EBP信息技术与信息学标准(VERSION 2.1)
IT and Informatics Standards
update
近日,由深圳国家基因库等多家单位参与制定的地球生物基因组计划信息技术与信息学标准(VERSION 2.1)正式发布。
地球生物基因组计划(EBP)信息技术与信息学标准(VERSION 2.1)在上一个版本的基础上更新了EBP数据共享和管理的政策及最佳实践。本次EBP信息技术与信息学标准的更新将进一步推进EBP及其成员对EBP项目收集的基因组及其元数据进行背景分析和再利用。
地球生物基因组计划(EBP)被称为生物登月计划,由美国史密斯森研究协会、英国桑格研究所、中国华大以及巴西的圣保罗研究基金会等机构发起,旨在用10年的时间,对地球上所有真核生物的基因组进行测序、编目和表征。2022年1月,地球生物基因组计划开启新阶段:从试点项目转向全面生产测序。
地球生物基因组计划 (EBP) 的这一新阶段以在美国国家科学院院刊上发表的一系列论文为标志,描述了该项目的目标、迄今为止的成就和下一步计划。
点击图片了解更多
深圳国家基因库长期关注生物多样性保育和数据安全共享,不仅参与EBP信息技术与信息学标准制定,还为EBP项目提供数据存储与共享支持。
# 参与数据标准制定 促进数据共享
2021年3月,由深圳国家基因库等多家单位参与制定的EBP信息技术与信息学标准(VERSION 1.0)正式发布,国家基因库序列归档系统(CNSA)成为EBP的推荐存储库。
👉 点击上图了解更多
# 主办数据标准研讨会,推进数据政策交流
2022年3月,深圳国家基因库主办并邀请美国国立卫生研究院、英国桑格研究所、欧洲生物信息中心等30余位基因组领域专家参与基因组数据标准研讨会,推进全球科研项目及数据政策交流,并于今年9月整理和更新EBP信息技术与信息学标准(VERSION 2.1)。
# 覆盖CNS等 支撑10余篇EBP重磅成果发表
截至目前,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)已支撑10余篇EBP项目成果发表:早期哺乳动物单孔目性别染色体进化研究,其成果发表在Nature期刊;绒猴完美基因组及染色体性别演化研究,成果发表在Nature期刊;远古鱼及肺鱼呼吸功能演化研究,发表2篇Cell封面文章;海洋哺乳动物基因组演化研究成果发表于PNAS期刊;大熊猫亚种分化年代及濒危分子机制研究成果发表于Science Bulletin期刊;全球3,366份鹰嘴豆遗传多样性研究发表于Nature期刊;揭示六千年生菜栽培驯化迁徙及抗病分子机制的成果发表于Nature Genetics期刊;金粟兰早期被子植物演化基因组研究发表于Nature Communications期刊;427种竹子重测序及地理区系研究发表于Nature Communications期刊;红豆杉基因组及代谢通路研究发表于Molecular Plant期刊等...