源资科技与Schrödinger达成战略合作，加速推进中国药物研发创新

源资信息科技（上海）有限公司（以下简称 “源资科技”）宣布已与 Schrödinger 公司达成战略合作协议。根据协议，源资科技将作为 Schrödinger 在中国的战略合作伙伴，为本地客户提供完整解决方案与专业技术服务。双方将发挥各自优势，共同构建创新生态体系，加速推动中国药物发现的数字化转型。

近年来，中国创新药行业进入快速发展阶段，分子建模、人工智能以及计算平台在提升研发效率方面发挥着愈发关键的作用。本次合作标志着 Schrödinger 卓著的计算技术与源资科技深厚及专业服务能力实现深度融合，为中国制药企业及科研机构提供更加系统且高质量的支持。

Schrödinger药物设计平台

高效计算模拟引擎助力创新药研发

Schrödinger（薛定谔）综合计算模拟平台以前沿的物理模型与人工智能算法为核心，为创新药物研发提供从靶点识别到候选化合物优化的全流程解决方案。平台覆盖小分子药物与生物大分子药物的关键研发环节，通过高精度算法大幅提升研发效率，缩短传统研发周期。

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精准分子对接与虚拟筛选

Glide提供从高通量虚拟筛选到高精度结合模式预测的全方位解决方案。针对不同阶段的筛选需求，Glide提供三种精度模式：HTVS（高通量虚拟筛选）可实现百万级化合物的快速初筛；SP（标准精度）在速度与准确性间取得平衡；XP（附加精度）提供最精确的结合模式预测。

在实际应用中，研究人员通常采用分级筛选策略：首先使用HTVS模式快速缩小化合物范围，然后通过SP模式进一步富集，最后利用XP模式精确评估最有潜力的化合物。这种递进式工作流能显著提高虚拟筛选的效率与成功率。

Fig. Glide是Schrödinger虚拟筛选工作流程的关键要素

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结合位点识别与评估

当面对全新靶点时，识别潜在的配体结合位点是关键第一步。SiteMap通过探测蛋白表面的形状、疏水性和氢键能力等物理化学属性，系统评估所有可能的结合口袋，并使用SiteScore对它们的"成药性"进行排序。

SiteMap不仅能识别主要的活性位点，还能发现潜在的变构位点，为药物设计提供更多可能性。其生成的三维等高线图直观显示结合口袋的特征，直接指导后续的分子对接和化合物优化。

Fig. Sitemap对6DN3 RNA与黄素类似配体 BRX1555结合模式的预测

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高精度结合亲和力预测

传统对接打分函数在预测结合亲和力方面存在局限，FEP+基于自由能微扰理论，能够以实验级的精度预测蛋白-配体结合自由能。该方法采用先进的OPLS4力场和增强采样技术，预测值与实验测定值通常具有高度相关性。

在先导化合物优化阶段，FEP+可准确评估细微结构变化对结合亲和力的影响，指导化学家优先合成最有潜力的化合物。此外，FEP+还能预测点突变对蛋白稳定性和亲和力的影响，为蛋白工程提供重要参考。

Fig. 利用FEP+对缺乏实验结构或基于低分辨率结构的蛋白质模型进行验证

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分子动力学与结合机制研究

生物分子在生理条件下处于动态状态，其功能与构象变化密切相关。Desmond支持微秒级的分子动力学模拟，揭示蛋白构象变化、配体结合路径等关键动态信息。

Desmond的混合溶剂分子动力学（MxMD）技术能够通过分析探针分子的占位情况，绘制结合热点图谱，发现传统结构分析中难以识别的隐蔽口袋，为药物设计提供新的靶点。

WaterMap专门分析结合位点中水分子的热力学行为，识别不稳定的高能量水分子。通过设计配体官能团取代这些不利水分子，可显著提高结合亲和力，这一策略在实际项目中屡次取得成功。

Fig. Desmond的混合溶剂分子动力学（MxMD）通过分析探针占位情况，可绘制结合热点图谱揭示隐蔽口袋，并评估靶标表面的"可成药性"。

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抗体与大分子药物设计

针对生物大分子药物研发的特殊需求，BioLuminate提供专业的抗体建模与优化工具。其在CDR-H3区的结构预测方面表现出色，为抗体人源化和亲和力成熟提供可靠的结构基础。

PIPER是经过CAPRI盲测验证的蛋白-蛋白对接工具，特别针对抗体-抗原复合物进行了优化。基于快速傅里叶变换算法，PIPER能够高效采样数十亿种结合取向，精准预测蛋白复合物结构。

BioLuminate还整合了蛋白聚集倾向预测、翻译后修饰分析等功能，全面支持生物药的理性设计。

Fig. 基于Schrödinger的BioLuminate进行抗体分子建模

Schrödinger（薛定谔）为解决药物研发中的结合模式预测、亲和力优化、代谢稳定性等关键挑战提供了高效的解决方案，推动创新药物研发迈向新高度。