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Nat. Comput. Sci. | 一种具备化学精度的分子结构优化黎曼去噪模型

用户1151118

分子结构优化的精度直接决定了计算化学与分子设计任务的可靠性。研究人员提出了一种基于物理约束黎曼流形的去噪模型(R-DM),用于实现具有化学精度的分子结构优化。不...

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Nature | RFdiffusion: David Baker 团队打造的原子级抗体从头设计新范式

用户1151118

抗体在现代医学中扮演核心角色,但目前尚无方法能够在完全计算机模拟的条件下设计出新的、针对特定表位的抗体。现有抗体发现依赖免疫实验、随机文库筛选或直接从患者体内分...

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Nat. Mach. Intell. | 图 Transformer 驱动的生成对抗网络实现靶点导向的候选药物分子全新设计

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发现全新候选药物分子是药物开发的核心步骤。深度生成模型能够从学习到的概率分布中采样新分子结构,但其在药物发现中的实际应用取决于能否生成针对特定靶点的化合物。研究...

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Science | 深度生成模型助力设计高翻译效率与高稳定性的mRNA序列

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尽管mRNA新冠疫苗取得了巨大成功,但要将其应用拓展至更多疾病,仍需显著提升蛋白质表达水平与持续时间。研究人员提出了 GEMORNA,一种基于Transform...

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TarPass:靶标感知分子生成模型的全面基准测评与启示

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在AI驱动药物发现的浪潮中,靶标感知分子生成模型被寄予厚望——它们理论上能精准锚定蛋白质靶标特征,高效生成具有潜在活性的新型化合物,大幅缩短早期药物研发周期。但...

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J. Cheminf. | PoLiGenX:精准控制的AI配体生成新范式,潜空间条件扩散驱动的先导化合物优化

用户1151118

在AI药物发现的浪潮中,如何在保证配体与蛋白结合能力的同时,兼顾形状相似性与化学多样性,一直是先导化合物优化的核心挑战。来自辉瑞机器学习研究团队的最新研究 Po...

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Nat. Commun. | 原子、键双扩散+性质引导的靶点感知3D分子生成模型

用户1151118

在 AI 辅助药物设计的赛道上,3D 分子生成模型常陷入 “两难困境”—— 要么结构离谱(比如出现能量不稳的三元环),要么类药性拉胯(结合力强却难合成)。【现在...

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Chem. Sci. | PepINVENT:基于生成式 AI 的天然与非天然氨基酸肽设计新框架

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期刊: Chemical Science 链接: https://doi.org/10.1039/d4sc07642g 代码: https://github.c...

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Nat. Mach. Intell. | GeoDirDock:一种融合领域先验的引导式扩散分子对接方法及其在药物发现中的应用

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该论文提出 GeoDirDock(GDD)方法,创新地将领域先验知识通过Geodesic引导融入扩散模型,解决传统盲扩散对接的结合位点定位与构象物理合理性问题。...

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Science | BioEmu:AI突破分子动力学极限 × Baker团队又一新作:RosettaFold-3

用户1151118

期刊: Science 链接: https://doi.org/10.1126/science.adv9817 代码: BioEmu 模型及推理代码: http...

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ActivityDiff:基于正负向活性引导的扩散模型在从头药物设计中的应用

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期刊: arXiv 链接: https://www.arxiv.org/abs/2508.06364 代码: https://github.com/e-yi/A...

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CANDO:稳健、精准且具普适性的药物发现平台基准测试策略

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期刊: bioRxiv 链接: https://doi.org/10.1101/2024.12.10.627863 代码: https://github.com...

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基于机器学习的药物-受体非键相互作用通用模型:靶标偏好图谱的构建

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期刊: bioRxiv 链接: https://doi.org/10.1101/2025.08.01.668090 简介: 该论文提出了一种基于机器学习的通用模...

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Commun. Chem. | VAE × 主动学习 × 物理建模,让分子自己进化

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期刊: Communications Chemistry 链接: https://doi.org/10.1038/s42004-025-01635-7 代码: ...

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Commun. Chem. | FRATTVAE:基于片段树 Transformer 的变分自编码器

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期刊: Communications Chemistry 链接: https://doi.org/10.1038/s42004-025-01640-w 代码: ...

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国内多所顶尖机构联合研发 AuroBind:突破虚拟筛选瓶颈,解锁海量未被开发蛋白质的成药潜力

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期刊: arxiv 链接: https://www.arxiv.org/abs/2508.02137 代码: https://github.com/GENTEL...

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基于自下而上策略的超大化学空间先导化合物发现:BRD4(BD1)靶点的验证与启示

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期刊: Communications Chemistry 链接: https://doi.org/10.1038/s42004-025-01610-2 简介: ...

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Baishenglai 平台:AI 驱动的药物发现全流程解决方案

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期刊: arxiv 链接: https://www.arxiv.org/abs/2508.01195 简介: 本文提出了一个名为 Baishenglai(BSL...

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J. Med. Chem. | CLaSP:对比学习引导的潜在评分平台

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期刊: Journal of Medicinal Chemistry 链接: https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c01...

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Nat. Biomed. Eng. | PrimeGen:用大语言模型重新定义引物设计自动化

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期刊: Nature Biomedical Engineering 链接: https://doi.org/10.1038/s41551-025-01455-z...

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