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问ValueError:在Python3.X的SpectralCoclustering中，数组不能包含infs或NaNs
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Stack Overflow用户

提问于 2017-07-19 18:55:17

回答 1查看 2K关注 0票数 1

data = np.genfromtxt("breastCancer.txt", delimiter=',').astype(np.float32)
data = data[~np.isnan(data).any(axis=1)]

ROW, COLUMN = data.shape

label = data[:, -1]
input = data[:, 1:COLUMN - 1]

scaler = preprocessing.MinMaxScaler(feature_range=(-1.0, 1.0))
scaler.fit(input)
input = scaler.transform(input)

model = SpectralCoClustering(n_clusters=3, random_state=0)
model.fit(input)

我试图获得(-1.0，1.0)范围内的数据集的双聚类。在我的数据中，我没有任何inf或nan。但是它抛出了一个ValueError: array must not contain infs or NaNs in SpectralCoclustering错误。你能帮帮我吗？我需要一个范围(-1，1)的数据集，所以我不想将其更改为正范围。

python-3.x

cluster-analysis

valueerror

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2018-02-07 16:33:45

我花了两天时间解决同样的问题。我的解决方案是:在执行model.fit(input)之前，我从input中删除了只有0的列

remaining_collumns=input.getnnz(1)>0
input=input[remaining_collumns,:]
model.fit(input)

还要注意，在我的例子中，input是由TfidfVectorizer.fit_transform返回的，并且是以sparse.csr.csr_matrix的形式返回的

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https://stackoverflow.com/questions/45198876

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