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生信技能树

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生信流程大全-基于nextflow的nf-core
题目:The nf-core framework for community-curated bioinformatics pipelines
生信技能树
2020-03-10
3K0
cox可以火山图为什么gsea结果不行
前面我在生信技能树分享过 批量cox生存分析结果也可以火山图可视化 介绍了火山图的基础认识,同时也给了大家代码可以批量做cox分析,并且绘制出来火山图。 最近看到一个文献,是数据集:https://w
生信技能树
2020-03-06
8320
1999元生信公共数据库挖掘视频资源免费送(生信必备资源)
①实验操作:细胞、分子、蛋白等各种实验操作百度云视频;②软件实操:Stata、revman、SPSS等各种软件及实操百度云视频;③生信挖掘:GEO、TCGA、Oncomine、KEGG、基因家族、GO、Meta等各种生信挖掘全套百度云视频;④雅思托福:最新全套视频课程,拉进百度云群一起学习,还可以找同道好友共同复习;⑤医学考博:最新全套视频课程,拉进百度云群一起学习,还可以找同道好友共同复习;⑥临床医生:规培、主治、副高、主任医师各种临床考试百度云视频;⑦SCI:模板、写作、作图、润色、中汉互译、投稿等全套百度云视频资源;⑧GRE/GMAT:最新全套视频课程,拉进百度云群一起学习,还可以找同道好友共同复习;⑨国自然:已中标的国自然申报书,国自然申报视频教学等全套百度云视频资源;
生信技能树
2019-06-19
2.3K0
根据甲基化探针信号值把样本分成CIMP组
Methylation datasets of 529 TCGA COADREAD samples were obtained from https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/. For the 2000 probes showing the highest variance in the TCGA samples, we made clustered heat maps of β values for only the TCGA samples.
生信技能树
2019-06-10
4430
单细胞转录组数据分析必读综述
摸索单细胞转录组数据分析这两年,我遇到过太多的CNS文章及综述,但只有本文被我安排给了所有人进行翻译,本译文来自于最优秀的学习者,最开始在不到3000粉丝的单细胞天地公众号发布,却喜获近5000的阅读量。
生信技能树
2019-05-20
6.4K0
2.5万汉族人的GWAS乳腺癌风险基因
今天是大年初七,给大家带来的是2.5万汉族人的GWAS乳腺癌风险基因,希望你能学到知识。
生信技能树
2019-03-07
1.3K0
StatQuest生物统计学2019再出发
少数圈内好友应该是早就得到消息,我会邀请statquest主讲人,YouTube博主,joshua来大陆访问,计划在3月中旬举办粉丝见面会,可惜美国政策太炒蛋,行程胎死腹中。 不过joshua的视频教程仍然是值得大力推荐!
生信技能树
2019-03-07
9200
全网第一个单细胞转录组数据分析实战视频教程
回首年前开创的单细胞天地公众号,再看看单细胞转录组知识星球的精华资源,一年时间就这样过去了,感慨万千!
生信技能树
2018-12-29
4.5K0
生物信息发文章哪家强
随着生物信息的发展,生物信息学相关的文章近 10 年呈现大量增加的趋势。世间万物皆可比较,你有没有想过,生物信息发文章哪家强(山东技校找蓝翔)?
生信技能树
2018-12-29
1K0
芯片的探针ID找到基因名-基于R语言-一文就够
这些bioconductor注释包规律是一样的,都是存储一下探针ID及其对应的基因名的关系而已。
生信技能树
2018-12-26
3K0
癌症易感基因筛查策略
先测 9个 WES数据在 early-onset familial breast cancer patients without BRCA1/2 mutations 定位到关注的基因,然后在中等规模人群队列里面 检测 RECQL gene in an additional 439 unrelated familial breast cancer patients. (注意作者挑选特定情况的乳腺癌患者做WES数据)
生信技能树
2018-12-26
6260
下载所有芯片探针序列并且写成fasta文件
选择在GEO官网的GPL平台下载 : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL21827 rm(list = ls()) ## 魔
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2018-12-25
1.4K0
在R里面对坐标进行映射
这里的重点其实是grange对象和intersect及findOverlaps函数的使用。
生信技能树
2018-12-25
8260
送你一篇TCGA数据挖掘文章
UCSC Xena网址:https://xena.ucsc.edu/public-hubs/
生信技能树
2018-12-24
4K6
我眼中的生物信息学-学习指南-北京基因组所小talk
机缘巧合之下在北京基因组所一楼报告厅分享了一下自己的一些简单的学习心得,应该是对大部分听众会有些帮助,下面是图片版PPT分享,欢迎收藏学习,或者文末有网盘下载地址,也可以下载到电脑观看!
生信技能树
2018-12-24
1K0
基因表达调控的顺式作用因子 (CREs) 了解一下
基因表达调控 基因调控是现代分子生物学研究的中心课题之一。因为要了解动植物生长发育规律、形态结构特征及生物学功能,就必须搞清楚基因表达在时间和空间上的调控机制,掌握了它,就等于掌握了一把揭示生物学奥秘的钥匙。 基因表达是一个多阶段进程(multi-level process)。DNA(脱氧核糖核酸)在转录为RNA(核糖核酸)后,RNA需要经过一系列转录后调控(post-transcriptional regulation)而被翻译为功能蛋白。先前来自多家实验室的研究结果清晰地显示,RNA转录水平至多能够解释
生信技能树
2018-03-29
7.2K0
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