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预测RNA三级结构

http composer 图像处理

http://rnacomposer.cs.put.poznan.pl/ 输入RNA序列和二级结构，邮箱地址，点击compose即可。

2021-03-03

4.2K1

RNA结构分析（2）通过核苷酸序列预测二级结构

1.输入核苷酸序列 2.点击运行 RNAfold web server http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi

2021-01-26

3.7K1

云服务器如何安装图形化界面和pymol

ubuntu apt-get linux http 云服务器

Ubuntu系列弹性云服务器默认没有安装图形化界面，如果需要图形化界面，需要进行安装。

2020-11-26

6.4K1

使用R语言绘制string蛋白互作图

编程算法数据库 sql https http

STRING（https://www.string-db.org）是已知和预测的蛋白质-蛋白质相互作用的数据库。交互包括直接（物理）关联和间接（功能）关联。数据库包含来自众多来源的信息，包括实验资料库，计算预测方法和公共文本集。每次互动都与组合的置信度相关综合各种证据的分数。目前，涵盖了来自5090的超过24百万种蛋白质生物。STRING数据库可用于在基因列表中添加含义。STRINGdb R软件包，以方便用户访问STRING中的数据库。在本指南中，以示例说明了该软件包的大多数功能。此外，iGraph包作为代表蛋白质-蛋白质相互作用网络的数据结构。

2020-09-01

2.4K0

miRTarBase数据库

http 数据库 sql

miRTarBase数据库是一个专门收集有实验证据支持的microRNA-mRNA靶向关系（MTI, MicroRNA-Target Interactions）的数据库。自miRTarBase数据库于2011年首次亮相以来，miRNA与靶基因相关信息的数据库不断更新。该数据库已经收录了超过8,500篇关于miRNA-靶标相互作用的实验支持文章。随着新发布的CLIP-seq数据集的增加，新miRTarBase中的MTI集合超过500,000。作者通过改进NLP（自然语言）技术，搜集到更多靶向关系对以及他们的网络功能和注释信息。数据库网址：http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/index.html

2019-09-20

1.9K0

零代码功能富集分析（DAVID数据库、KOBAS数据库使用教程）

go http 数据库 sql

DAVID （the Database for Annotation，Visualization and Integrated Discovery）的网址是http://david.abcc.ncifcrf.gov/。 DAVID是一个生物信息数据库，也是一款在线免费分析软件，其整合了生物学数据和分析工具，为大规模的基因或蛋白列表（成百上千个基因ID或者蛋白ID列表）提供系统综合的生物功能注释信息，帮助用户从中提取生物学信息。目前DAVID数据库主要用于差异基因的功能和通路富集分析，对很多科研工作者来说，是个非常好的工具。

2019-07-25

6.9K0

R包install失败：cannot open URL

https http 网络安全单片机

Warning: unable to access index for repository https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/contrib: cannot open URL 'https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES'

2019-07-22

4.5K0

R.python常见问题②（一些需要编译的包）

在R语言的广泛包中，大部分可以直接install.packages()直接命令安装，但是有些包安装过程比较复杂，例如'lightgbm,ggplot2所依赖的‘rlang’包，devtools所依赖的‘pkgload’,这三个包是我目前经常遇到的需要编译的包，安装过程比较复杂且慢。

2018-12-12

1.2K0

使用R语言分析微信好友

微信 python http 爬虫

上篇使用python分析微信好友 - 简书 https://www.jianshu.com/p/c7f1b400d20a python爬虫：数据保存后用R语言作图分析

2018-10-08

2.1K0

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