碱基矿工

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黄树嘉

今天看到美国的 All of US 第一期10万人的基因组项目成果发出来了。我去它们网站想进一步看看数据概貌的时候发现,原来还多出了几种性别,嗯,很政治正确啊😂。 另一个感叹就是,他们确实快啊。

今天看到美国的 All of US 第一期10万人的基因组项目成果发出来了。我去它们网站想进一步看看数据概貌的时候发现,原来还多出了几种性别,嗯,很政治正确啊?...

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黄树嘉

今天在看NAR的database专刊时无意发现“国家基因组科学数据中心”在这上面连续6年每年都发一篇介绍中心的文章,图片4-9分别对应2017-2022的文章主图。我服了,原来可以这样干!每年都更新一

今天在看NAR的database专刊时无意发现“国家基因组科学数据中心”在这上面连续6年每年都发一篇介绍中心的文章,图片4-9分别对应2017-2022的文章主...

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黄树嘉

共病遗传的研究方法:关于多发性硬化症和炎症性肠炎遗传共病研究的例子

全文6,358字(不含代码),8 图,阅读 25 分钟。封面图源:pexels.com

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黄树嘉

ilus: 这是我写的一个轻量级全基因组(WGS)和全外显子(WES)最佳实践分析流程生成器

不知觉间,距离我写下第一篇关于 WGS 数据分析系列的文章已经过去了三年多(WGS系列文章),时间真的快啊。

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黄树嘉

AlphaFold2虽然开源了,但并非能即开即用!

并行AI云预装AlphaFold2软件,即开即用,可实现分钟级获取计算实例。此外针对特定计算环境部署需求自主、灵活构建,并提供详细运行手册及参数介绍,助你轻松使...

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黄树嘉

碱基周报(第 004 期):全球十大主要基因组学项目盘点

这是目前用得最广也是影响最大的一个国际联合基因组项目。2008年发起由英国Sanger研究所、美国 NHGRI 等多家科研机构共同发起的国际多人群基因组学项目,...

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黄树嘉

碱基周报(第 003 期):人类起源的故事

从东非大裂谷形成直到演变成东非稀树草原,地球就进入了人类纪元。从600万年前开始,人族部落发生分裂,我们与猿的关系从此结束了[1]。

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黄树嘉

人类基因组时代的泛基因组学

今天想分享一个主题:人类基因组时代的泛基因组学。主要内容源自今年《Nature Reviews Genetics》上一篇题为《Pan-genomics in t...

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黄树嘉

为什么不能通过 GATK 的 PL 直接计算基因型剂量(Genotype dosage)

GATK 的 PL 比较特殊,它是不能直接用于基因型剂量(Genotype dosage)的计算的。这次我们就来谈一谈这个问题。

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黄树嘉

生物信息 awk 用法进阶

全文6,829字(含代码),阅读18分钟。配图来源:《The AWK Programming Language》

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黄树嘉

如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所传递的信息

在GWAS研究中,Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图,它们可以把跟研究的性状(比如,基因型和身高)显著相关的基因位点清晰地展现出来,不...

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黄树嘉

生物信息 awk 简明教程和基本用法

awk 是处理文本文件的一个应用程序,几乎所有的Linux以及MacOS都自带这个程序。

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