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#plot

Nature | 5月14日发表:空间转录组文章复现(四)

天意生信云

在前三篇文章中,我们按照文章的结果顺序依次复现了Figure1、Figure2、Figure3。Figure1构建了人类胎儿大脑皮层的空间图谱,并构建了三个层级...

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海涅定理(Heine 定理)

云深无际

海涅定理(Heine 定理)是实分析中连接函数极限与数列极限的重要桥梁。它的核心思想是:

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Nature | 5月14日新发表:空间转录组文章复现(二)

天意生信云

今天我们接着复现文章上周分享的文章《Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area ...

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🤩 miRTalk | 单细胞miRNA推断及细胞间通讯!~

生信漫卷

3️⃣ 第三部分是可视化miRNA介导的细胞间通讯网络和miRNA-靶点相互作用网络。

8000

新版 CellphoneDB v5 新增功能:ktplots绘图包尝鲜

生信技能树

老习惯,CellphoneDB 的官网给到你:https://cellphonedb.readthedocs.io/en/latest/

23900

🤩 enrichment_all | 一键完成富集分析!~(配高颜值可视化!)

生信漫卷

最近做这些富集分析实在太烦了,我就自己写了2个函数,run_enrichment_all()和plot_enrichment_all()。😂

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R tips:解决monocle的plot_genes_branched_heatmap函数报错

生信菜鸟团

最近在使用monocle的plot_genes_branched_heatmap函数进行BEAM分支热图绘制时发生了一个报错,如下:

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顶刊杂志Nat Med.(IF=58.7)同款GSVA打分结果可视化

生信技能树

这个打分的双向条形图我印象中最深的是他出现在2018年8月24发表在顶刊杂志Nat Med.(IF=58.7)中,文献的标题为《Phenotype moldin...

24410

展示你的特征基因:带"辣椒粉"的markers基因umap图

生信技能树

今天来看看如何展示你的特征基因,这个需求在单细胞分析中非常常见。图来自文献《The aged tumor microenvironment limits T c...

17400

TME髓系亚群细分“一本通”

生信菜鸟团

作者从44例TNBC患者中获得了78份肿瘤活检样本,鉴定出28个T细胞子集,14个B细胞子集,11 NK细胞子集和18个髓细胞子集。

18300

数学建模--浅谈多波束测线问题

阑梦清川

这个是国赛的真题,我们这个里面只是浅谈,就是对于这个里面运用的过程仿真的思路进行说明,这个探测的波束问题实际上也是一个简单的过程仿真问题,也是需要去进行作图的,...

13810

多性状或者多个模型的QQ和曼哈顿重叠图

邓飞

之前介绍了好几篇QQ图和曼哈顿图的绘制GWAS的曼哈顿图和QQ图diamante,GWAS分析QQ图挺好,曼哈顿图没有显著性,如何调整阈值,今天介绍一下多个性状...

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单细胞分析 | 基因组区域的可视化 (2)

数据科学工厂

"heights" 和 "widths" 参数用于调整各个轨迹图的相对高度和宽度,调整的顺序依据它们在 plotlist 中的排列。CombineTracks(...

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单细胞 | 转录因子足迹分析

数据科学工厂

要执行足迹分析,必须首先向对象中添加Motif 信息,这包括每个Motif 的精确位置。这一过程可以通过使用“motif”和“packages”这两个包中的函数...

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R语言非线性混合效应 NLME模型(固定效应&随机效应)对抗哮喘药物茶碱动力学研究

拓端

此处,时间是从抽取样品时开始给药的时间(h),浓度是测得的茶碱浓度(mg/L),体重是受试者的体重(kg)。

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转录组可视化的全年度爱用包:TOmicsVis

生信技能树

前面给大家介绍过一款单细胞数据可视化大全年度爱用包:《终于有人对Seurat包丑到哭的可视化出手了:年度爱用包!》

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一个批量做LDblock的脚本

邓飞

今天,有小伙伴在星球询问GWAS分析的显著性位点,如何批量绘制LDblock,之前写过LDblock的安装和使用说明:(LDblock绘制连锁不平衡和单体型图)

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不看KM-plot,不做cox回归,怎么量化哪个组的预后好

用户11414625

讲课讲到批量的logrank test可以告诉我们两个组之间的生存率差别是否显著,收到提问说:

10400

R用户要整点python--pandas画图

用户11414625

因为pandas的.plot方法时以matplotlib为基础的,所以每次画图之前要先import matplotlib.pyplot as plt,画图之后又...

14200

听说你的KM-plot p值>0.05

用户11414625

KM-plot是生存分析最常用的图表,没有之一。它接受的分组依据必须是离散型的数据,就是固定分成有限的几类,不能是数值这样的连续型数据。

13500
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