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Circos 软件的安装详解
对象存储
http
perl
circos 是一款perl 语言开发的画图软件,提供了染色体相关数据的一种可视化方式。其制作的图表精美,被科研工作者广泛使用。
生信修炼手册
2020-05-11
1.2K
0
circos 可视化手册- text 篇
编程算法
perl
不论是heatmap, 还是scatter, histogram, 反映的都是基因组上某段区域对应的value值的分布,这里的value都是数值。对于value是字符串的情况,专门定义了text这种图表类型,用于展示。
生信修炼手册
2020-05-10
1.1K
0
ANNOVAR变异位点注释软件
数据库
sql
linux
perl
ANNOVAR 是一款变异位点注释软件,提供了多方位的注释功能,支持多个物种,是最受欢迎的注释软件之一。
生信修炼手册
2020-05-10
1.3K
0
RNAmmer:预测基因组上的核糖体RNA
perl
xml
html
na
核糖体RNA, 缩写为rRNA, 是细胞内含量最多的一类RNA, 能够与蛋白质结合形成核糖体,完成氨基酸的合成。rRNA分子量较大,通常利用沉降系数来区分不同类别的rRNA,沉降系数越大,分子量越大。
生信修炼手册
2020-05-08
1.1K
0
SSRIT:简单重复序列识别工具
perl
微卫星microsatellite, 又叫做简单重复序列(simple sequence repeats, SSR)或者短串联重复序列(short tandem repeats, STR), 指的是以2到10bp的短序列为单位,重复出现多次所构成的DNA序列。
生信修炼手册
2020-05-08
1.9K
0
python中的正则表达式
编程算法
正则表达式
perl
则表达式, 是一门独立的搜索和匹配字符串的语言,只不过在各种编程语言中得到了实现,其中perl语言的正则表达式堪称是范本,很多其他编程语言都参考perl的正则语法来实现。python中的正则表达式通过内置模块re来实现,与perl的正则表达式操作类似,如果你熟悉perl语言的话,对于python的正则也可以轻松上手。
生信修炼手册
2020-05-07
963
0
python中字典dict的操作技巧汇总
python
perl
编程算法
字典是使用最为广泛的数据结构了,从结构来看,其内容就是键值对,键称为key, 值称为value, 类似词典中通过前面的索引来快速查找后面的页面,通过key可以快速定位对应的值。字典,是python中对这种结构的命名,在其他语言中有其他的名字,比如perl中称之为哈希。
生信修炼手册
2020-05-07
1.3K
0
Juicer软件的安装详解
python
perl
java
软件安装是生物信息实战中最基础的技能之一,只有确保软件安装无误,后续使用起来才会得心应手,不会有很多的bug。juicer软件提供了Hi-C数据一键化分析的pipeline, 这样高度的封装使得用户操作起来更加简便,当然分析能力强大的同时其依赖的软件就会越多,安装过程的复杂程度也会有所提高,本文主要记录下该软件的安装过程,可以分为以下几个步骤
生信修炼手册
2019-12-19
4.6K
0
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