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使用python自动化发送邮件
html
tcp/ip
python
数据分析
smtplib模块是对SMTP协议的封装，用于发送邮件；email模块用于构建邮件内容，支持以下3种形式的邮件
生信修炼手册
2020-12-11
725
0
scrapy实践之中间件的使用
http
scrapy
selenium
tcp/ip
python
在scrapy框架中，Downloader Middlewares 称之为下载中间件， 可以对爬虫的requests请求进行封装处理，典型的应用有以下3种
生信修炼手册
2020-11-25
480
0
IP代理在网络爬虫中的应用
tcp/ip
数据分析
api
http
费用中心
通过用户代理我们可以将普通的爬虫程序伪装成浏览器，而IP代理的作用则是用于突破目标服务器对同一IP访问频率的限制。
生信修炼手册
2020-11-02
396
0
numpy中的掩码数组
tcp/ip
编程算法
numpy
numpy中有一个掩码数组的概念，需要通过子模块numpy.ma来创建，基本的创建方式如下
生信修炼手册
2020-06-10
1.8K
0
miRWalk:综合型的miRNA靶基因数据库
数据库
sql
tcp/ip
数据结构
miRWalk是一个综合性的miRNA靶基因数据库，收录了人，小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息，和mirDIP类似，也是一个整合型数据库，整合了来自miRDB, TargetScan, miRTarBase等数据库中的信息，网址如下
生信修炼手册
2020-05-08
926
0
mirDIP:最全面的人类miRNA靶基因数据库
数据库
sql
tcp/ip
miRNA靶基因预测是研究miRNA功能机制必经的一个环节，现有的相关软件和数据库非常多，然而不同软件的算法各有优劣，在不同数据库之间的交叉检索费时费力，所以需要一个整合多个数据库和软件资源的集成型数据库，mirDIP就是在这样的驱动下产生，集成了30个来源数据库中human相关的靶基因信息，网址如下
生信修炼手册
2020-05-08
551
0
使用ASProfile分析可变剪切事件
tcp/ip
ASprofile是一款识别可变剪切事件的软件，该软件可以直接将同一个基因的多个转录本进行比较，从而鉴定可变剪切事件，官网如下
生信修炼手册
2020-05-08
2.7K
1
footprintDB:综合性的转录因子数据库
tcp/ip
数据库
sql
node.js
http
transcription factors表示转录因子的名称，对应的基因，家族，序列等基本信息，DNA motifs代表该转录因子结合区域的保守模式，DNA binding sites代表该转录因子实际的结合区域，target genes代表转录因子调控的靶基因。
生信修炼手册
2020-05-08
890
0
peak差异分析的工具那么多，如何选择？
腾讯云开发者社区
tcp/ip
对于ATAC_seq, chip_seq等抗体富集型文库而言，peak calling是分析的第一步。通过peak calling,可以得到抗体富集的区域，这些区域有对应的生物学功能，在chip_seq中，可以是转录因子结合区或者发生组蛋白修饰的区域，ATAC中对应的就是开放染色质区域。
生信修炼手册
2020-05-07
3.6K
0
bigwig归一化方式详解
tcp/ip
黑石物理服务器
在chip_seq数据展示时，经常会用到bigwig文件，导入igvtools等基因组浏览器中，产生如下所示的图片
生信修炼手册
2019-12-19
2.8K
0
MACS:使用最广泛的peak calling软件之一
tcp/ip
MACS全称是Model-based Analysis of ChIP-Seq，是使用的最广泛的peak calling软件之一，其基本原理简介如下
生信修炼手册
2019-12-19
1.3K
0
使用ChIPpeakAnno进行peak注释
tcp/ip
ChIPpeakAnno是一个bioconductor上的R包，针对peak calling之后的下游分析，提供了以下多种功能
生信修炼手册
2019-12-19
2K
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