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图形化开放式生信分析系统开发
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图形化开放式生信分析系统开发 - 1 需求分析及技术实现V2(2020.7更新)
云服务器
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从2017年前开始,工作的原因接触到了NGS(高通量测序技术 High-throughput sequencing又称“下一代”测序技术"Next-generation" sequencing technology)技术和相关的生物信息学分析。
SliverWorkspace
2020-07-29
918
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图形化开放式生信分析系统开发 - 5 生信分析流程服务器端运行
shell
数据库
sql
在上文图形化开放式生信分析系统开发 - 4 生信分析流程的图形化设计 讨论了生信分析pipeline的图形化,如何用图形的方式显示生信pipeline,但是pipeline脚本按照变量的形式保存之后,如何运行,在什么环境下运行?是本文要解决的问题。
SliverWorkspace
2020-01-17
795
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图形化开放式生信分析系统开发 - 3 生信分析流程的进化
shell
bash
bash 指令
接上两篇内容,本文主要讲述工作中NGS从科研进入医学临床领域,工作中接触到生信流程,以及最终在实现的过程。
SliverWorkspace
2020-01-17
969
0
图形化开放式生信分析系统开发 - 1 需求分析及技术实现
容器镜像服务
自动化
shell
网站
从三年前开始,工作的原因接触到了NGS(二代测序)技术和相关的生信分析,在公司技术到临床应用转化过程中遇到一系列问题,在问题中挣扎、解决问题的过程中逐渐有了开发一套通用生信分析系统的想法,到目前已经完成了由想法到产品的转化,有必要做一下记录以便复盘:本文为系列文章的第一篇。
SliverWorkspace
2019-12-28
1.2K
2
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