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搭建自己的本地云平台，QIIME2图形界面玩转16S分析（WSL2+Docker+Galaxy qiime2）
容器镜像服务
http
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ubuntu
windows
之前分享过一个 qiime2 studio 图形界面的笔记(QIIME2图形界面版（Q2STUDIO）），是 qiime2 团队自己造的轮子，不过最近 qiime2 团队好像转向了利用 galaxy 轮子QIIME 2 2021.4 发布（qiime2 支持 galaxy 啦），还把官方的宣传和安装视频转载到过公众号，不过之前没有加字幕，看起来还是有点困难的，重新加了中英文字幕并校对了下。
用户1075469
2022-11-08
948
0
NGS数据进行HLA分型
容器镜像服务
容器
发现已经下载不到的软件是hla-hd, hlascan, 本来一直信任xhla，却发现这个软件竟然处理手上这个特殊的样本也报了个罕见错误，大概是可能性比较多，代码bug。soap-hla运行个perl报错，hlarepoter也没跑成功。
用户1075469
2020-11-03
1.3K
0
qiime2+biom+qiime1获得16S物种丰度
python
容器镜像服务
excel
mac
sed
我们知道，不管是16S等扩增子测序，还是宏基因组，最后最重要的结果，就是物种的丰度情况了，qiime2给出的16S丰度结果是一个计数，对于许多软件来说这是可用的，那么如果我们想获得一个直接的百分比数据应该怎样做呢？
用户1075469
2020-06-23
1.5K
0
ubiome类似数据dada2处理探索2
http
https
网络安全
html
容器镜像服务
首先把usearch申请下载到工作目录，然后docker挂载到home，当然如果linux就直接省了这一步了，可以下载（安装）好直接使用。
用户1075469
2020-03-03
625
0
GUTHEALTHY镜像使用笔记
容器镜像服务
容器
github
perl
发现一个中国疾控中心的工作人员zhangwen2001做的一个docker，刚好最近在分析肠道微生物的数据，学习学习。动用我的自以为比较厉害的搜索和查找信息的能力，终于找到了镜像文件。先把github的地址放在这：
用户1075469
2020-03-03
317
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