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mummer2circos 是一个用于绘制细菌基因组的圈图(circos 图)的工具。它基于 BLAST 或 NUCMER/PROMER 的比对结果,生成 SV...
hello,hello!小伙伴们大家好,我是小编豆豆,好久没有给大家分享使用的脚本了,最近小编在一直在忙着16s整理数据库,需要下载大量物种的16s rRNA...
今年 12 月,QIIME 2 团队选择放弃计划的 2023.11 版本,转而减少拉取请求的长队列并开发一些新功能。
Prodigal[1] 由橡树岭国家实验室[2]和田纳西大学诺克斯维尔分校[3]于 2007 年在能源部联合基因组研究所[4]的主持下联合开发,是一种用于细菌和...
小编欢乐豆又放出一个珍藏多年的脚本,2749 行的长度,长到已经难以用 GPT 解读啦,不过用起来还是很方便的!这个 perl 脚本用于将 GenBank 格式...
我们小编欢乐豆有个压箱底的 perl 脚本,由于编程语言"洁癖",想要彻底抛弃 perl 语言转向 python,于是他使用 AI 辅助下进行了转换,由于脚本相...
qiime2 有自带的差异分析工具的(composition ancom),可是,大家已经习惯了一直用的 lefse,于是,把 qiime2 的结果导出进行 l...
全球生物样本库荟萃分析倡议 (GBMI) 旨在创建一个框架,以启动全球生物样本库和倡议合作。这个简单框架的好处包括但不限于:
最近搜索发现了个新的生物银行,分享一下,summary statistics可下载。
计划的下一个QIIME 2版本计划于2023年2月发布(QIIME2 2023.12)。
提示近期正在维护,暂时没有任何内容可供查看下载了。不过,GWAS Catalog的还是可以下载的,点赞!
有同学和我交流离线的牛津纳米孔16S测序数据分析的问题,感慨的确这种方案还是少的,我想主要原因之前大家的印象还是相比Pacbio和短读长,成本高,准确性还是差了...
今天看到官网论坛上宣布,QIIME 2 2023.7 版本现已发布!计划的下一个QIIME 2版本计划于2023年9月发布(QIIME 2023.9),本次更新...
之前从qiime2的更新介绍中了解到了这个模块,这里再详细了解一下!哪天用起来呀!
并行化、断点续分析、输出集合、基于阴性对照识别污染、宏基因组学工作流程(即将推出!)
hello,hello!小伙伴们大家下午好,我是小编豆豆,之前小编给大家分享了NC学宏基因组分析流程,今天小编再给大家分享一篇宏基因流程,文章提供完整的分析流...
做了一次搬运工,把 Qiime2 官方教程搬到了 B 站,B 站确实有机器的字幕,但是现阶段的 AI 字幕对于生物领域还是比较不友好的,特别是对于些专有名词,比...
今天继续我们的跟着NC学流程系列,之前小编分享了关于16S扩增子测序和宏基因组数据分析的机教程。考虑到许多小伙伴是做人类基因组方面的,今天分享一篇癌症早筛方面的...
hello,hello! 小伙伴们大家下午好,我是小编豆豆,时光飞逝,不知不觉来南京工作已经一年了,从2018年参加工作至今,今年是我工作最快乐的一年,遇到一群...
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