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R语言系列第五期:③R语言逻辑回归预测和检验

在上一篇文章里,无论原始数据是表格式的还是罗列式的,我们都可以建立起相应的逻辑回归模型。详情点击:R语言系列五:②R语言与逻辑回归建立 但是模型建立起来之后,是用来做什么的?...当然,我们也可以直接显示概率刻度下的预测值,需要在predict函数设定参数type=“response”: > predict(glm.hyp,type="response") 1...当然,我们建立了模型之后,肯定要利用模型说明问题,但是我们建立的模型到底好不好,我们又必须给出适当的判断。 对于表格式的数据,很明显,我们应该去比较观测和拟合出来的值的占比。...在前面高血压的例子,我们可以计算各组水平概率(下面的是实际概率): > fitted(glm.hyp) 1 2 3 4 0.08377892...使用prop.table()函数,我们之前提过,它会计算tb表格每行行内数据构成比(1表示行,2表示列),随后[,2]表示只保留第二列,即yes的那一列;最后,绘制关于期望概率的图,与观测占比的图叠加起来

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【CV】PAA论文解读:物体检测利用概率分布来将anchor分配为正负样本

导读 又一篇anchor匹配策略的文章,不过确实是简单有效,ATSS上只需要很小的修改就可以提升性能。GFL2框的预测上用上了概率分布,这里又在anchor匹配上用上了概率分布。...我们首先计算anchor在当前模型条件下的得分,然后用这些得分拟合一个概率分布出来,然后利用这个概率分布来区分正负样本,然后模型再用这些正负样本进行训练。...基于这种假设,模型计算出来的得分是从这个概率分布采样出来的,我们期望模型可以从概率的角度去infer具有可分性的样本,让训练变得更加容易。...正样本数量是由这个概率分布自适应的决定的,这个是和其他不利用模型状态的分配方法的最大的区别。 总结一下我们这个方法,并将其嵌入到训练过程和目标函数,如下: ?...2.2 IoU预测作为质量评分 训练的时候,anchor的得分是从训练目标得到的(包括两种loss),但是推理的时候,NMS只使用分类的得分,为了改进这个问题,可以预测一个质量得分,这样,训练时候的评分函数可以直接用到推理的

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R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(4)——logistic回归

R语言中用于实现logistic回归的函数是glm(),其基本书写格式为: glm(formula, family = gaussian, data, weights, subset, na.action...参数介绍: Formula:指定用于拟合的模型公式,类似于Im的用法: Family: 指定描述干扰项的概率分 布和模型的连接函数, 默认值为gaussian, 若需进行logistic同归,则需设置为...再根据前面介绍的模型进行logit变换的逆变换,输出结果存储到变量prob,此时该变量的值即为响应变量取值为1的概率值,即变量Species=virginica的概率值,然后分别计算变量prob中大于...最后利用函数table( )统计原始数据的记录和预测结果的记录情况(“0”表示versicolor,“1”表示virginica), 不难发现,输出的表格,数字“48”和“49”均表示预测正确的总数...除此之外,还可以利用图形展示模型的预测效果,业界一般采用ROC曲线对logistic 回归模型的效果进行刻画,R语言的RORC包中有专门的函数用于刻画ROC曲线,具体操作如下: > library(ROCR

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R语言系列五:②R语言与逻辑回归建立

这样我们就可以描述或推测某些不同状况下得某种疾病的风险或者说阳性时间发生的概率。这里自然而然就引入我们今天的主题:逻辑回归模型——logistic regression model。...我们是对一个事件发生的概率直接建模,而二元输出的变异性将由此概率来确定。因此,与正态分布不同,这里没有方差这个参数。...我们这里按照数据的原始类型分类来讲解不同的原始数据应该怎样通过R语言建立逻辑回归模型。 ? A. 表格化数据的逻辑回归 ?...而把这些变量放到一个数据框,输出更加直观好看。 对于表格化的数据进行逻辑回归分析,R中有两种途径。...而R做的就是以小的数字做参照,来计算大的数字发生的概率(有参数可以设置那个值作为参照)。我们计算一下这个群体月经初潮年龄的预期中位数(P=0.5),其实就是logit P=0的年龄。

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Logistic回归模型、应用建模案例

logistic回归的公式可以表示为: 其中P是响应变量取1的概率0-1变量的情形,这个概率就等于响应变量的期望。...TPR也称为Sensitivity(即生物统计学的敏感度),也可以称为“正例的覆盖率”——将实际为1的样本数找出来的概率。...不使用模型的情况下,我们用先验概率估计正例的比例,即(c+d)/(a+b+c+d),可以记为k。 定义提升值lift=PV/k。 lift揭示了logistic模型的效果。...下面利用logistic回归进行建模,得到intercept和conc的系数为-6.47和5.57,由此可见麻醉剂量超过1.16(6.47/5.57)时,病人静止概率超过50%。...',xlab='麻醉剂量') lines(y~x,lty=2,col='blue') 案例二:利用iris数据集,进行逻辑回归二分类测试,该数据集是R语言自带得数据集,包括四个属性,和三个分类。

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R语言逻辑回归和泊松回归模型对发生交通事故概率建模

利用泊松过程模型,我们可以获得 这意味着一年的前六个月中没有索赔的概率是一年没有索赔的平方根。...假设可以 通过一些链接函数(使用GLM术语)表示为一些协变量来解释没有索赔的概率, 现在,因为我们确实观察到   而不是   我们有 我们将使用的数据集 > T1= contrat$nocontrat...实际上,使用两个模型,可以进行更复杂的回归分析(例如使用样条曲线),以可视化年龄对发生或不发生交通事故概率的影响。...的偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR) 4.R语言泊松Poisson回归模型分析案例 5.R语言回归中的Hosmer-Lemeshow拟合优度检验 6.r语言中对LASSO回归,Ridge...岭回归和Elastic Net模型实现 7.R语言中实现Logistic逻辑回归 8.python用线性回归预测股票价格 9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

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R语言非线性回归和广义线性模型:泊松、伽马、逻辑回归、Beta回归分析机动车事故、小鼠感染、蛤蜊数据、补剂钠摄入数据|数据分享

部分原因是这里的响应变量残差不是正态分布的,而是泊松分布,因为它是计数数据。 泊松回归 具有泊松误差的广义线性模型通常具有对数链接,尽管也可以具有恒等链接。...忽略异常值测试,因为更详细的观察我们发现没有异常值。 我们还可以查看预测与量化残差图。...二项分布 二项分布有两个参数,成功的概率和硬币投掷的次数。得到的分布始终介于0和1之间。考虑使用不同概率进行15次硬币投掷的情况。...二项式逻辑回归 二项逻辑回归中,我们主要是估计获得正面的概率。然后我们以权重的形式提供(而不是估计)试验次数。这里使用的典型链接函数是logit函数,因为它描述了一个0和1之间饱和的逻辑函数。...R,我们可以使用两种形式来参数化二项逻辑回归 - 这两种形式是等价的,因为它们将结果扩展为成功次数和总试验次数。

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数据分享|R语言用lme4多层次(混合效应)广义线性模型(GLM),逻辑回归分析教育留级调查数据|附代码数据

此外,本教程还简要演示了用RGLM模型进行的多层次扩展。最后,还讨论了GLM框架的更多分布和链接函数。 本教程包含以下结构。 准备工作。 介绍GLM。 加载教育数据。 数据准备。...构建二元逻辑回归模型 R默认安装了基础包,其中包括运行GLMglm函数。glm的参数与lm的参数相似:公式和数据。...然而,glm需要一个额外的参数:family,它指定了结果变量的假设分布;family我们还需要指定链接函数。...目前的数据,目标变量是留级。我们从 "留级 "组和 "不留级 "组随机抽取一名学生。预测概率较高的学生应该是 "留级 "组的学生。AUC是随机抽出的对子的百分比。...拟合二项式Logistic回归模型 为了拟合二项式逻辑回归模型,我们也使用glm函数。唯一的区别是公式对结果变量的说明。

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R语言与机器学习学习笔记(分类算法

像这样的,对概率P做一点变换,让变换后的取值范围变得合理,且变换后我们能够有办法进 行参数估计的,就涉及到广义线性模型理论的连接函数。...但是probit也有它合理的一面,首先,中心极限定理告诉我们,伯努利分布样本够多的时候就是近似正态分布的;其次,从不确定性的角度考虑,probit认为我们的线性概率模型服从正态分布,这也是更为合理的。...但是logistic回归中,由于logit(p)变化的特殊性,解释定序变量时,为了减少自由度(即解释变量个数),我们常常将定序变量(如家庭收入分为高、、低)视为连续的数值变量,而且经济解释可以是XX...五、广义线性模型的R实现 R语言提供了广义线性模型的拟合函数glm(),其调用格式如下: glm(formula, family = gaussian, data,weights, subset, na.action...Data:数据集 鸢尾花例子使用的R代码: logit.fit <- glm(Species~Petal.Width+Petal.Length, family = binomial(link = 'logit

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R语言与机器学习学习笔记(分类算法

像这样的,对概率P做一点变换,让变换后的取值范围变得合理,且变换后我们能够有办法进 行参数估计的,就涉及到广义线性模型理论的连接函数。...但是probit也有它合理的一面,首先,中心极限定理告诉我们,伯努利分布样本够多的时候就是近似正态分布的;其次,从不确定性的角度考虑,probit认为我们的线性概率模型服从正态分布,这也是更为合理的。...但是logistic回归中,由于logit(p)变化的特殊性,解释定序变量时,为了减少自由度(即解释变量个数),我们常常将定序变量(如家庭收入分为高、、低)视为连续的数值变量,而且经济解释可以是XX...五、广义线性模型的R实现 R语言提供了广义线性模型的拟合函数glm(),其调用格式如下: glm(formula, family = gaussian, data,weights, subset, na.action...Data:数据集 鸢尾花例子使用的R代码: logit.fit <- glm(Species~Petal.Width+Petal.Length, family = binomial(link = 'logit

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R语言与机器学习(分类算法)logistic回归

像这样的,对概率P做一点变换,让变换后的取值范围变得合理,且变换后我们能够有办法进行参数估计的,就涉及到广义线性模型理论的连接函数。...多项 Logit模型虽然好用,但从上面的叙述可以看出,多项 Logit 模型最大的限制在于各个类别必须是对等的,因此可供选择的类别,不可有主要类别和次要类别混杂在一起的情形。...四、dummy variable logistic回归中,经常会遇到解释变量为分类变量的情形,比如收入:高、、低;地域:北京、上海、广州等。...但是logistic回归中,由于logit(p)变化的特殊性,解释定序变量时,为了减少自由度(即解释变量个数),我们常常将定序变量(如家庭收入分为高、、低)视为连续的数值变量,而且经济解释可以是XX...五、广义线性模型的R实现 R语言提供了广义线性模型的拟合函数glm(),其调用格式如下: glm(formula, family = gaussian, data,weights,

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R语言用lme4多层次(混合效应)广义线性模型(GLM),逻辑回归分析教育调查数据

具体来说,本教程重点介绍逻辑回归二元结果和计数/比例结果情况下的使用,以及模型评估的方法。本教程使用教育数据例子进行模型的应用。此外,本教程还简要演示了用RGLM模型进行的多层次扩展。...构建二元逻辑回归模型 R默认安装了基础包,其中包括运行GLMglm函数。glm的参数与lm的参数相似:公式和数据。...然而,glm需要一个额外的参数:family,它指定了结果变量的假设分布;family我们还需要指定链接函数。...目前的数据,目标变量是留级。我们从 "留级 "组和 "不留级 "组随机抽取一名学生。预测概率较高的学生应该是 "留级 "组的学生。AUC是随机抽出的对子的百分比。...拟合二项式Logistic回归模型 为了拟合二项式逻辑回归模型,我们也使用glm函数。唯一的区别是公式对结果变量的说明。

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R语言广义线性模型(GLMs)算法和零膨胀模型分析

p=14887 广义线性模型(GLM) 是通过连接函数,把自变量线性组合和因变量的概率分布连起来,该概率分布可以是高斯分布、二项分布、多项式分布、泊松分布、伽马分布、指数分布。...利用泰勒展开式 ​ ​ 假使 ​,考虑平方根变换g(y)= \ sqrt {y} g(y)= y,则第二个等式变为 ​ 因此,通过平方根变换,我们具有方差稳定性,可以将其解释为一定的同调性。...在那种情况下,运行带有对数链接函数的伯努利回归,首先与对原始数据运行泊松回归,然后我们的二进制变量零和非零上使用。...让我们先生成一些模拟数据,比较从标准逻辑回归得到的eλx和px regPois = glm(Y~....Gibbs抽样的贝叶斯简单线性回归仿真分析 5.r语言中使用GAM(广义相加模型)进行电力负荷时间序列分析 6.使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型HLM 7.R语言中的岭回归

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R语言回归中的Hosmer-Lemeshow拟合优度检验

具体而言,基于估计的参数值,对于样本的每个观察,基于每个观察的协变量值计算概率。 然后根据样本的预测概率将样本的观察分成g组(我们回过头来选择g)。假设(通常如此)g = 10。...在实践,只要我们的一些模型协变量是连续的,每个观测将具有不同的预测概率,因此预测的概率将在我们形成的每个组变化。...为了计算我们预期的观察数量,Hosmer-Lemeshow测试取组预测概率的平均值,并将其乘以组的观察数。...R 首先,我们将使用一个协变量x模拟逻辑回归模型的一些数据,然后拟合正确的逻辑回归模型。...由于此处正确指定了模型,因此我们希望这种所谓的类型1错误率不大于5%: [1] 0.04 因此,1,000次模拟,Hosmer-Lemeshow测试4%的情况下给出了显着的p值,表明不合适。

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R」处理glm.fit: fitted probabilities numerically 0 or 1 occurred

: Warning message: glm.fit: fitted probabilities numerically 0 or 1 occurred 当拟合逻辑回归模型,且数据框中一个或多个观测值的预测概率与...本教程将分享如何在实践处理此警告消息。...重复警告 假设我们将logistic回归模型拟合到R的以下数据框: #create data frame df <- data.frame(y = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1,...(3) 移除离群值 在其他情况下,当原始数据框架存在异常值,且只有少量观测值拟合的概率接近0或1时,就会出现这种错误。通过去除这些异常值,警告信息通常就消失了。...其他资源 下面的教程解释了如何处理R的其他警告和错误: How to Fix in R: invalid model formula in ExtractVars[1] How to Fix in R

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【学习】R语言与机器学习(分类算法)logistic回归

像这样的,对概率P做一点变换,让变换后的取值范围变得合理,且变换后我们能够有办法进行参数估计的,就涉及到广义线性模型理论的连接函数。...四、dummy variable logistic回归中,经常会遇到解释变量为分类变量的情形,比如收入:高、、低;地域:北京、上海、广州等。...但是logistic回归中,由于logit(p)变化的特殊性,解释定序变量时,为了减少自由度(即解释变量个数),我们常常将定序变量(如家庭收入分为高、、低)视为连续的数值变量,而且经济解释可以是XX...五、广义线性模型的R实现 R语言提供了广义线性模型的拟合函数glm(),其调用格式如下: glm(formula, family = gaussian, data,weights,...Tips: oddsratio=p/1-p 相对风险指数 贝努力模型 P是发生A事件的概率,1-p是不发生A事件的概率 所以p/1-p是 发生与不发生的相对风险。

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数据分享|R语言用lme4多层次(混合效应)广义线性模型(GLM),逻辑回归分析教育留级调查数据

此外,本教程还简要演示了用RGLM模型进行的多层次扩展。最后,还讨论了GLM框架的更多分布和链接函数。 本教程包含以下结构。 准备工作。 介绍GLM。 加载教育数据。 数据准备。...构建二元逻辑回归模型 R默认安装了基础包,其中包括运行GLMglm函数。glm的参数与lm的参数相似:公式和数据。...然而,glm需要一个额外的参数:family,它指定了结果变量的假设分布;family我们还需要指定链接函数。...目前的数据,目标变量是留级。我们从 "留级 "组和 "不留级 "组随机抽取一名学生。预测概率较高的学生应该是 "留级 "组的学生。AUC是随机抽出的对子的百分比。...拟合二项式Logistic回归模型 为了拟合二项式逻辑回归模型,我们也使用glm函数。唯一的区别是公式对结果变量的说明。

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R语言用lme4多层次(混合效应)广义线性模型(GLM),逻辑回归分析教育留级调查数据

此外,本教程还简要演示了用RGLM模型进行的多层次扩展。最后,还讨论了GLM框架的更多分布和链接函数。 本教程包含以下结构。 1. 准备工作。 2. 介绍GLM。 3. 加载教育数据。 4....构建二元逻辑回归模型 R默认安装了基础包,其中包括运行GLMglm函数。glm的参数与lm的参数相似:公式和数据。...然而,glm需要一个额外的参数:family,它指定了结果变量的假设分布;family我们还需要指定链接函数。...目前的数据,目标变量是留级。我们从 "留级 "组和 "不留级 "组随机抽取一名学生。预测概率较高的学生应该是 "留级 "组的学生。AUC是随机抽出的对子的百分比。...拟合二项式Logistic回归模型 为了拟合二项式逻辑回归模型,我们也使用glm函数。唯一的区别是公式对结果变量的说明。

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MADlib——基于SQL的数据挖掘解决方案(12)——回归之广义线性模型

广义线性模型是一般线性模型的直接扩展,它使因变量的总体均值通过一个非线性连接函数(link function,如上例的ln),而依赖于线性预测值,同时还允许响应概率分布为指数分布族的任何一员。...广义线性模型两个方面对普通线性模型进行了扩展: 一般线性模型要求因变量是连续的且服从正态分布。广义线性模型,因变量的分布可扩展到非连续的,如二项分布、泊松分布、负二项分布等。...与madlib.linregr_train线性回归训练函数不同,madlib.glm不返回R2决定系数,而是用对数似然值评估模型的拟合程度。统计学,似然函数是一种关于统计模型参数的函数。...给定输出x时,关于参数θ的似然函数L(θ|x)(在数值上)等于给定参数θ后变量X的概率:L(θ|x)=P(X=x|θ)。...该例子,伽马分布的三种连接函数identity、inverse和log对应的似然函数值分别为-8.0938、-1.1282和-5.6723。对数似然函数绝对值越小,表示拟合程度越好。

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