首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

在Julia中对大型数组中的列集进行二次采样的最快方法

是使用多线程和内存映射技术。

首先,使用Julia的多线程功能可以将任务并行化,加快采样的速度。可以使用@threads宏来标记需要并行执行的代码块。

其次,对于大型数组,可以使用内存映射技术将数组映射到磁盘上的文件,以减少内存占用。可以使用mmap函数将文件映射为内存中的数组。

下面是一个示例代码,演示了如何使用多线程和内存映射来对大型数组进行二次采样:

代码语言:julia
复制
using Base.Threads

function subsample_columns(data::AbstractMatrix, sample_ratio::Float64)
    num_cols = size(data, 2)
    num_sampled_cols = Int(round(num_cols * sample_ratio))
    sampled_cols = Vector{Int}(undef, num_sampled_cols)

    @threads for i in 1:num_sampled_cols
        sampled_cols[i] = rand(1:num_cols)
    end

    sampled_data = similar(data, size(data, 1), num_sampled_cols)

    @threads for i in 1:num_sampled_cols
        sampled_data[:, i] = data[:, sampled_cols[i]]
    end

    return sampled_data, sampled_cols
end

# 示例用法
data = rand(1000, 10000)  # 假设有一个1000行10000列的大型数组
sampled_data, sampled_cols = subsample_columns(data, 0.1)  # 对列集进行10%的二次采样

在上述示例代码中,subsample_columns函数接受一个二维数组data和采样比例sample_ratio作为输入,返回采样后的数据sampled_data和采样到的列索引sampled_cols。该函数使用多线程并行地生成采样的列索引,并使用内存映射技术创建一个与原始数据相同大小的数组sampled_data,并将采样到的列复制到该数组中。

这种方法的优势在于利用了多线程和内存映射技术,可以在处理大型数组时提高采样的速度和降低内存占用。

推荐的腾讯云相关产品:腾讯云服务器(https://cloud.tencent.com/product/cvm)和腾讯云对象存储(https://cloud.tencent.com/product/cos)。

请注意,本答案仅提供了一种可能的解决方案,实际情况可能因数据规模、硬件配置等因素而有所不同。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

在PHP中使用SPL库中的对象方法进行XML与数组的转换

在PHP中使用SPL库中的对象方法进行XML与数组的转换 虽说现在很多的服务提供商都会提供 JSON 接口供我们使用,但是,还是有不少的服务依然必须使用 XML 作为接口格式,这就需要我们来对 XML...而 PHP 中并没有像 json_encode() 、 json_decode() 这样的函数能够让我们方便地进行转换,所以在操作 XML 数据时,大家往往都需要自己写代码来实现。...我们在客户端生成了 SimpleXMLIterator 对象,并传递到 xmlToArray() 方法中。...在 phpToXml() 的代码中,我们还使用了 get_object_vars() 函数。就是当传递进来的数组项内容是对象时,通过这个函数可以获取对象的所有属性。...测试代码: https://github.com/zhangyue0503/dev-blog/blob/master/php/202009/source/在PHP中使用SPL库中的对象方法进行XML与数组的转换

6K10

Python环境下的8种简单线性回归算法

但我们不可夸大线性模型(快速且准确地)拟合大型数据集的重要性。如本文所示,在线性回归模型中,「线性」一词指的是回归系数,而不是特征的 degree。...通过为用户提供高级命令,以及用于操作和可视化数据的类,SciPy 显著增强了 Python 的交互式会话。 以下对各种方法进行简要讨论。...一个小窍门是,在调用这个函数之前,你必须要在 x 数据上附加一列 1,才能计算截距项。结果显示,这是处理线性回归问题最快速的方法之一。...如果使用的方法本来就很慢,那么在面对大型数据集的时候便会出现执行的瓶颈问题。 一个判断算法能力可扩展性的好办法,是用不断扩大的数据集来测试数据,然后提取所有试验的执行时间,画出趋势图。...这篇文章首要目标是讨论上述 8 种方法相关的速度/计算复杂度。我们通过在一个合成的规模逐渐增大的数据集(最大到 1 千万个样本)上进行实验,我们测出了每种方法的计算复杂度。

1.6K90
  • Python环境下的8种简单线性回归算法

    但我们不可夸大线性模型(快速且准确地)拟合大型数据集的重要性。如本文所示,在线性回归模型中,「线性」一词指的是回归系数,而不是特征的 degree。...通过为用户提供高级命令,以及用于操作和可视化数据的类,SciPy 显著增强了 Python 的交互式会话。 以下对各种方法进行简要讨论。...借助这个方法,你既可以进行简单变量回归又可以进行多变量回归。你可以返回计算的系数与残差。一个小窍门是,在调用这个函数之前,你必须要在 x 数据上附加一列 1,才能计算截距项。...如果使用的方法本来就很慢,那么在面对大型数据集的时候便会出现执行的瓶颈问题。 一个判断算法能力可扩展性的好办法,是用不断扩大的数据集来测试数据,然后提取所有试验的执行时间,画出趋势图。...这篇文章首要目标是讨论上述 8 种方法相关的速度/计算复杂度。我们通过在一个合成的规模逐渐增大的数据集(最大到 1 千万个样本)上进行实验,我们测出了每种方法的计算复杂度。

    1.6K90

    Python环境下的8种简单线性回归算法

    但我们不可夸大线性模型(快速且准确地)拟合大型数据集的重要性。如本文所示,在线性回归模型中,「线性」一词指的是回归系数,而不是特征的 degree。...通过为用户提供高级命令,以及用于操作和可视化数据的类,SciPy 显著增强了 Python 的交互式会话。 以下对各种方法进行简要讨论。...一个小窍门是,在调用这个函数之前,你必须要在 x 数据上附加一列 1,才能计算截距项。结果显示,这是处理线性回归问题最快速的方法之一。...如果使用的方法本来就很慢,那么在面对大型数据集的时候便会出现执行的瓶颈问题。 一个判断算法能力可扩展性的好办法,是用不断扩大的数据集来测试数据,然后提取所有试验的执行时间,画出趋势图。...这篇文章首要目标是讨论上述 8 种方法相关的速度/计算复杂度。我们通过在一个合成的规模逐渐增大的数据集(最大到 1 千万个样本)上进行实验,我们测出了每种方法的计算复杂度。

    1.2K00

    如何优化一个传统分析方法还发了14分

    文章中作者对大规模单细胞RNA测序的基准主成分进行了分析。...在本研究中,作者检查了用于大型scRNA-seq数据集的快速且内存高效的PCA算法的实用性。 二. 分析流程 ? 三....结果解读 作者先回顾了一下现有的PCA算法及其实现(图1),图1是对这项工作中的基准测试概述。 ? 图1a. 这项工作的示意图 ? 图1b. 使用实际数据集进行基准测试的评估指标 ? 图1c....其中,图7a展示了诸如二进制化和规范化之类的预处理步骤的经过时间(橙色条)以及每次PCA计算本身的经过时间(绿色条)。仅当对Brain数据集执行PCA实现时,作者才使用内部的Julia脚本进行预处理。...因此,作者根据语言对PCA实施进行了分类(即R [111],Python [112]和Julia [113];图8,按列)。

    83820

    Julia开源新框架SimpleChain:小型神经网络速度比PyTorch快5倍!

    从黑洞动力学到地震安全建筑的开发,SciML方法的有效性已经在许多学科中得到证实,能够灵活地发现/指导(生物)物理方程。...目前AI加速的工作主要集中于GPU内核加速,让指令运行尽可能快,由于这些大型矩阵-矩阵操作在GPU上是最快的,并且也是大模型的主要瓶颈,所以性能基准基本上只是衡量这些特定内核的速度; 3....矩阵操作只有在能够使用批处理(A*B中的B矩阵的每一列都是一个单独的批处理)时才会发生。 在大部分科学机器学习的情境下,如ODE邻接中的向量Jacobian乘积的计算,这种操作是矩阵-向量乘法。...开发人员的长期目标是将这种循环编译器的优化方法扩展到自动产生pullbacks。但这种以编译器为中心的方法已经被用于实现的便利性:虽然我们仍然需要手写梯度,但我们不需要对它们进行手工优化。...研究人员用一个2×2的矩阵做了一个实验,在带有AVX512指令集的Intel i9-10980XE跑了一下,1万个epoch花了0.41秒,相比之下pyTorch花了15秒,也就是说在这种微型神经网络上

    87440

    好强一个Julia!CSV数据读取,性能最高多出R、Python 22倍

    字符串数据集 I 此数据集在且具有1000k行和20列,并且所有列中不存在缺失值。 ? Pandas需要546毫秒来加载文件。 使用R,添加线程似乎不会导致任何性能提升。...在Julia,Python和R的测试中,引发了网友们更多关于“技术更新”的热烈讨论。...有些网友对于Julia给予了极大的期待: 在过去的十年中,大多数生态系统在Python上都具有巨大的价值,尤其是将MATLAB抛在脑后。...Julia对Python进行了足够的改进,可以保证在接下来的5-10年内进行转换,并以相同的方式将Python抛在后面。 ?...不过,也有网友表达了对“更新重置成本”的担忧: 我认为Python的生态系统已经成熟,并且在过去的1-2年中已成为标准,这具有巨大的价值。

    2K63

    Julia开源新框架SimpleChain:小型神经网络速度比PyTorch快5倍!

    从黑洞动力学到地震安全建筑的开发,SciML方法的有效性已经在许多学科中得到证实,能够灵活地发现/指导(生物)物理方程。...目前AI加速的工作主要集中于GPU内核加速,让指令运行尽可能快,由于这些大型矩阵-矩阵操作在GPU上是最快的,并且也是大模型的主要瓶颈,所以性能基准基本上只是衡量这些特定内核的速度; 3....矩阵操作只有在能够使用批处理(A*B中的B矩阵的每一列都是一个单独的批处理)时才会发生。 在大部分科学机器学习的情境下,如ODE邻接中的向量Jacobian乘积的计算,这种操作是矩阵-向量乘法。...开发人员的长期目标是将这种循环编译器的优化方法扩展到自动产生pullbacks。但这种以编译器为中心的方法已经被用于实现的便利性:虽然我们仍然需要手写梯度,但我们不需要对它们进行手工优化。...研究人员用一个2×2的矩阵做了一个实验,在带有AVX512指令集的Intel i9-10980XE跑了一下,1万个epoch花了0.41秒,相比之下pyTorch花了15秒,也就是说在这种微型神经网络上

    1.4K30

    Google && 耶鲁 | 提出HyperAttention,使ChatGLM2-32K 推理速度 提升50%!

    虽然取得了成功,但这些模型仍面临着严重的可扩展性限制,原因是对其注意力层的精确计算导致了二次(在序列长度上)运行时和内存复杂性。...最近的理论边界表明,在一般情况下,不可能在次二次时间内对注意力矩阵进行分项近似。...从理论上讲,KDEFormer 的运行时大约为 ;它采用核密度估计 (kernel density estimation,KDE) 来近似列范数,允许计算对注意力矩阵的列进行采样的概率。...此外,当该方法应用于预训练的 LLM (如 chatqlm2-6b-32k )并在长语境基准数据集 LongBench 上进行评估时,即使不需要微调,也能保持与原始模型接近的性能水平。...研究者还对特定任务进行了评估,他们发现总结和代码完成任务比问题解答任务对近似注意力层的影响更大。 算法 为了在近似 Att 时获得频谱保证,本文第一步是对矩阵 D 的对角线项进行 1 ± ε 近似。

    30620

    全新近似注意力机制HyperAttention:对长上下文友好、LLM推理提速50%

    虽然取得了成功,但这些模型仍面临着严重的可扩展性限制,原因是对其注意力层的精确计算导致了二次(在序列长度上)运行时和内存复杂性。...最近的理论边界表明,在一般情况下,不可能在次二次时间内对注意力矩阵进行分项近似。...从理论上讲,KDEFormer 的运行时大约为 ;它采用核密度估计 (kernel density estimation,KDE) 来近似列范数,允许计算对注意力矩阵的列进行采样的概率。...此外,当该方法应用于预训练的 LLM (如 chatqlm2-6b-32k )并在长语境基准数据集 LongBench 上进行评估时,即使不需要微调,也能保持与原始模型接近的性能水平。...研究者还对特定任务进行了评估,他们发现总结和代码完成任务比问题解答任务对近似注意力层的影响更大。 算法 为了在近似 Att 时获得频谱保证,本文第一步是对矩阵 D 的对角线项进行 1 ± ε 近似。

    31150

    Jeff Dean推荐:用TPU跑Julia程序,只需不到1000行代码

    Julia是一门集众家所长的编程语言。随着Julia 1.0在8月初正式发布,Julia语言已然成为机器学习编程的新宠。...使用这一编译器定位TPU,能够在0.23秒内对100张图像的VGG19前向传递进行评估,这与CPU上原始模型所需的52.4秒相比大幅加速了。...他们的实现仅需不到1000行Julia代码,没有对核心Julia编译器或任何其他Julia包进行TPU特定的更改。 具体方法和实现细节请阅读原论文。...Julia的标准库数组是可变的,并且在类型和维度上进行参数化。此外,StaticArrays.jl(Ferris&Contributors,2018)包提供了在元素类型和形状上进行参数化的不可变数组。...在本节中,我们证明了Julia编译器确实足够精确,使该方法适用于实际的程序。 VGG19 forward pass ?

    1.6K10

    Julia 对决Python:谁能在2019年称霸机器学习编程?

    同时,Python和R语言通常在机器学习中占主导地位,在开发人员普及方面,Python仍然是增长最快的编程语言。...Julia团队在博客文章中写道: 我们需要一种语言来编写可区分的算法,而Flux将帮助Julia成为满足这类需求的语言。 Julia非常适合用于数学和数值计算,并且非常适合表达ML算法。...根据Julia团队的博客文章,Flux库使用各种专注ML工具扩展了Julia的编译器,从而支持一流梯度,在性能和开发人员控制之间取得更好的平衡;为GPU及时进行CUDA内核编译,在训练期间进行自动批量处理...,以减少开销;在Google TPU上进行优化运行。...如今,Python和R语言通常在机器学习中占主导地位,在开发人员普及方面,Python仍然是增长最快的编程语言,这在很大程度上取决于其机器学习框架和库的优势。

    92520

    B站2021算法笔试题,选择题部分剖析(三)

    事务性并不是CAP中的要素,别和数据库ACID四原则弄混。 第二题 对于n个带权样本的随机有放回带权采样,采样m次。最优时间复杂度为? 表面上来看,这题考的是时间复杂度,其实本质上是在考察算法。...加权有放回采样速度最快的算法叫做alias采样算法,它的时间复杂度分为两个部分,预处理部分和采样的部分。其中预处理部分的复杂度是 ,每次采样的复杂度是 ,加起来的复杂度是 ,故选B。...第二个数组存的是填充的样本编号alias,在这个例子当中就是[1, null, 0, 0]。 我们在采样的时候会出两个随机数,第一个随机数在0-n之间,用来选择列。...留一法的意思是,将数据平均分成k份,每次用k-1份进行训练,留下一份作为验证,一共进行k次,这是一种解决训练样本不足的方法。 由于我们只有3条数据,所以对应每次会用2条进行训练,一条验证。...首先是(0, 1), (1, 1),训练之后得到的模型为y = 0x + 1。在(2, 0)位置的误差是1。 第二次选择(1, 1), (2, 0),得到的模型为y = -x + 2。

    93020

    学界 | MIT正式发布编程语言Julia 1.0:Python、R、C++三合一

    当然,Julia 1.0 中最重要的一个新特征是对语言 API 稳定性的承诺:为 Julia 1.0 编写的代码可以继续在 Julia 1.1、1.2 等版本上使用。...属性访问器重载还允许获取一列数据的语法匹配命名元组的语法:你可以编写 table.version 以访问表中的 version 列,这就和使用 row.version 访问行的 version 字段一样...Julia 1.0 没有设计三种不同泛型函数(start、next、done)的方法,而是设计 iterate 函数的一参数和二参数方法。这通常允许在开始状态使用包含默认值的单一定义来便捷地定义迭代。...未来,标准库还将出现多种版本,并独立于 Julia 更新,这使得它们可以更快地迭代。 我们已经对 Julia 的所有 API 进行了完全的评议,以改善稳定性和可用性。...对很多模糊的已有命名和无效的编程模式进行了重命名或重构,使之更匹配 Julia 的能力。

    1.2K20

    Python环境下的8种简单线性回归算法

    但我们不可夸大线性模型(快速且准确地)拟合大型数据集的重要性。如本文所示,在线性回归模型中,「线性」一词指的是回归系数,而不是特征的 degree。...通过为用户提供高级命令,以及用于操作和可视化数据的类,SciPy 显著增强了 Python 的交互式会话。 以下对各种方法进行简要讨论。...一个小窍门是,在调用这个函数之前,你必须要在 x 数据上附加一列 1,才能计算截距项。结果显示,这是处理线性回归问题最快速的方法之一。...如果使用的方法本来就很慢,那么在面对大型数据集的时候便会出现执行的瓶颈问题。 一个判断算法能力可扩展性的好办法,是用不断扩大的数据集来测试数据,然后提取所有试验的执行时间,画出趋势图。...这篇文章首要目标是讨论上述 8 种方法相关的速度/计算复杂度。我们通过在一个合成的规模逐渐增大的数据集(最大到 1 千万个样本)上进行实验,我们测出了每种方法的计算复杂度。

    1.2K50

    Julia

    为了评估R,Python和Julia中的不同实现,我生成了一个数据集,该数据集包含1.000.000范围从1到2.000.000的唯一整数,并执行了1.000个从1到1.000的所有整数的搜索。...然而,当转向循环方法时,原生领先了一个数量级……通过使用Numba包添加JIT编译,我给了NumPy第二次机会。...通过对这个简单问题的结果进行对比,我们发现: 在执行方面,Julia的性能几乎与C相当; Julia的例外是在编写类似R的矢量化代码时,性能下降了大约3倍。...Numba仍然在您的Python代码上施加了约束,这使该选项成为一种折衷; 在Python中,最好在原生列表和NumPy数组之间以及何时使用Numba之间进行选择:对于经验不足的人来说,最好的数据结构(...在内部,Julia在内存中存储了一个指针数组,以配合Any提供的灵活性。结果,Julia在处理数组时无法再处理连续的连续内存块。对性能有什么影响?慢大约50到100倍!

    2.4K20

    MIT正式发布编程语言Julia 1.0:Python、R、C++三合一

    当然,Julia 1.0 中最重要的一个新特征是对语言 API 稳定性的承诺:为 Julia 1.0 编写的代码可以继续在 Julia 1.1、1.2 等版本上使用。...属性访问器重载还允许获取一列数据的语法匹配命名元组的语法:你可以编写 table.version 以访问表中的 version 列,这就和使用 row.version 访问行的 version 字段一样...Julia 1.0 没有设计三种不同泛型函数(start、next、done)的方法,而是设计 iterate 函数的一参数和二参数方法。...未来,标准库还将出现多种版本,并独立于 Julia 更新,这使得它们可以更快地迭代。 我们已经对 Julia 的所有 API 进行了完全的评议,以改善稳定性和可用性。...对很多模糊的已有命名和无效的编程模式进行了重命名或重构,使之更匹配 Julia 的能力。

    1.1K40

    Julia机器学习核心编程.6

    一些常规语言都有的东西 提一嘴类型转换,指更改变量的类型,但是维持值不变的操作 数组是对象的可索引集合,例如整数、浮点数和布尔值,它们被存储在多维网格中。Julia中的数组可以包含任意类型的值。...在Julia中本身就存在数组这个概念。 在大多数编程语言中,数组的下标都是从0开始的。但是在Julia中,数组的下标是从1开始的。...DataFrames中的NA数据类型 在实际生活中,我们会遇到无值的数据。虽然Julia中的数组无法存储这种类型的值,但DataFrames包中提供了这种数据类型,即NA数据类型。...现在,假设此数据集在位置x[1]处有缺失值。这意味着该数据没有意义,而不是1.1。我们不能用Julia中的数组类型来表示。当尝试分配NA值时,将发生错误,我们无法将NA值添加到数组中。...NA并不总是影响应用于特定数据集的函数。因此,不涉及NA值或不受其影响的方法可以应用于数据集;如果涉及NA值,那么DataArray将给出NA作为结果。

    2.3K20

    为什么Julia比Python快?因为天生理念就更先进啊

    许多人认为 Julia 快是因为它使用的是 JIT 编译器,即每一条语句在使用前都先使用编译函数进行编译,不论是预先马上编译或之前先缓存编译。...一个 Vector{Float64} 中的内存排列等同于 C 语言双精度浮点数数组,这都使得它与 C 语言的交互操作变得简单(确实,某种意义上 Julia 是构建在 C 语言顶层的),且能带来高性能(对...Julia 基准 Julia 网站上的 Julia 基准能测试编程语言的不同模块,从而希望获取更快的速度。这并不意味着 Julia 基准会测试最快的实现,这也是我们对其主要的误解。...用于这类递归问题的最快优化方法是 Tail-Call Optimization,Julia 语言可以随时添加这类优化。...在 Python 中,我们可以将任何类型数据放入数组,但是在 Julia,我们只能将类型 T 放入到 Vector{T} 中。为了提供一般性,Julia 语言提供了各种非严格形式的类型。

    1.7K60

    为什么我不再推荐你用Julia?

    根据我的经验,在我使用过的所有编程系统中,Julia 及其包的错误率最高,我来举例说明一下: 对概率密度进行采样会出现错误; 对数组进行采样会产生有偏差的结果; 乘积函数可能对 8 位、16 位和 32...方法不检查别名而产生错误的结果; if-else 控制流程存在 bug。 我经常会遇到这样严重的错误,足以让我质疑 Julia 中复杂计算的正确性,在尝试新的包或者函数的组合时尤其如此。...我列出的问题包括: 存在 offset axes 的情况下,大多数采样方法都是不安全且不正确的; 拟合 DiscreteUniform 分布会返回不正确的答案; counteq、countne、sql2dist...@JordiBolibar:从我开始使用 Julia 进行研究以来,我在 Zygote 中遇到了两个 bug,这使我的工作减慢了几个月。...在 Julia 中,没有对一致性的强制执行,但泛型函数是很有效的。  Julia 当然有 bug,但没有一个是严重的。

    1.8K30
    领券