qiime2图形界面安装学习笔记

自从知道了qiime2有了图形界面，一直期待自己能安装测试一下，无奈安装了ubuntu和debian两个linux发行版都在npm安装包的过程中报错失败了，看官网的截图是ubuntu的，我却没有成功。于是我总觉得我的黑果应该可以安装成功。因为某果很封闭，软件统一性较高，我是这样觉得的，软件体验应该比较好（PS.我不是果粉，对苹果持中立态度，也坚信开源，所以我在大神的资料下装了黑果，也足够用了）。而各种linux发行版虽然比较自由，也存在着碎片化，虽然debian、ubuntu、cent等已经足够简单易用，并且兼容性不错了，但是linux/gnu生态仍需要加油啊！

单说我这次的安装过程，miniconda是以前安装好的，就按着官网的步骤来了，当然，国内的网络环境连接国外，镜像是必须的，上中科大或者清华源（据说中科大的bioconda源比较稳定，我是两个都添加了），在家里我是移动宽带，网速看心情啦。这次的安装还算比较顺利的，尝试了几次之后就成功了。这个时候，就必须要先删掉环境再使用yaml文件重新安装了。代码官网都一一给出了。地址放地这：https://docs.qiime2.org/2018.4/install/native/#install-qiime-2-within-a-conda-environment

1. 莫名的错误 安装完2018.4版后，激活环境时，报了两个错，大概是找不到java，但是还没有使用，不知道有没有影响，可能是系统安装了两个java冲突。错误如下：
2. source activate qiime2-2018.4 /Users/zd200572/miniconda3/envs/qiime2-2018.4/etc/conda/activate.d/activate_qiime2_envs.sh:5: no matches found: PYTHONNOUSERSITE=/Users/zd200572/miniconda3/envs/qiime2-2018.4/lib/python*/site-packages/ /Users/zd200572/miniconda3/envs/qiime2-2018.4/etc/conda/activate.d/java_home.sh:7: = not found
3. 战战兢兢地继续安装 怀着忐忑的心情，带着这个错误，继续按官网的教程安装，node选择用brew安装，感觉这样几乎不会报错，brew install node 然后下载q2studio软件包，解压，进入这个文件夹，安装pip python包之前也是没问题的，安装npm的包，这次有十几个warning，和上次一样，但是从头到尾没报错，成功。
4. 简单看一下 先来欣赏一下漂亮的界面，当然开头就说是一个产品原型，还没有正式发布，有一些功能没有。但是，图形界面意味着每一个生物工作者都可以用的生物信息工具。显然，以后大部分生物信息的工作是界面友好的，而且测序技术在进步，数据越来越好，处理也越来越简单了。

好了，工具好了，后面可以测试一下简单的数据分析了。下次见！