Nanopore-16S数据分析学习笔记2

这里要吐槽一下牛津纳米孔科技公司，既然是想要扩大应用，就不应该像苹果一样把整个系统搞的这么封闭，应该把软件，流程都公开开源，这样软件才能变多，社区才会更加活跃呀，只把软件和流程限制在一个拥有机器的社区里，我不认为这有利于该公司的发展。我不是商人，不理解公司的行为，或许这样是为了其公司的长远发展也未可知。

在百度、必应上一搜索，纳米孔+16S关键词，能找到的中文信息并不多，好几个还是我发的笔记。比较有价值的几个信息有：

1.https://tieba.baidu.com/f?kw=nanopore #纳米孔吧，有个比较活跃的吧主和前辈王通（基因学苑公众号创办人，前段时间他在公众号留言送纳米孔教程，我也领了一份）发的帖子，暂时没有多少人气，估计后面随着测序仪的改进和广泛应用会火。吧主说留言可以给出EPI2ME的教程，我留言了，期待教程。

2.http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102xte9.html 一个前辈的新浪博客，总结了Nanopore-16S数据分析的策略，并列出了篇文献,使用blasr和last比对,Kilianski A, Haas J L, Corriveau E J, et al. Bacterial and viral identification and differentiation by amplicon sequencing on the MinION nanopore sequencer[J]. Gigascience, 2015, 4(1): 12.。

3.https://community.nanoporetech.com/guides/minion/rna002/5/ 官方社区，不绑定机器现在可以注册，但不能查看EPI2ME的流程。可以看一个rna直接测序的教程，涉及了EPI2ME，就是这个链接，教程是十分详细，一步一步的。

4.https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10200625 咱中国台湾同胞的博客，涉及到了这一块，记录的比较详细了，我准备跟着这个走一遍。

阅读原文是我的博客，之前的纳米孔学习笔记在这：

1.纳米孔Nanopore-16S数据分析学习笔记

2.Nanopore牛津纳米孔测16S学习笔记

3.初识OXFORD NANOPORE