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33 篇文章
1
CellChat三部曲1:使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析
2
CellChat三部曲2:使用CellChat 对多个数据集细胞通讯进行比较分析
3
CellChat 三部曲3:具有不同细胞类型成分的多个数据集的细胞通讯比较分析
4
多个单细胞亚群合并
5
如何读取单细胞数据
6
纯生信单细胞数据挖掘-全代码放送
7
单细胞测序流程(单细胞rna测序)
8
单细胞亚群比例变化和表达量差异分析
9
生信中各种ID转换
10
单细胞功能注释和富集分析(GO、KEGG、GSEA)(2021公开课配套笔记)
11
细胞亚群的生物学命名
12
scRNA包学习Monocle2
13
单细胞转录组基础分析六:伪时间分析
14
Seurat包的findmarkers函数只能根据划分好的亚群进行差异分析吗
15
​cytoscape的十大插件之二--MCODE插件
16
从零到壹:Cytoscape插件使用心得~MCODE篇
17
cytoscape的cytohubba及MCODE插件寻找子网络hub基因
18
上下调基因各自独立进行GO数据库的3分类富集(求美图代码)
19
拟时序分析的热图提取基因问题
20
单细胞亚群合并与提取(2021公开课配套笔记)
21
单细胞转录组之Seurat包全流程-数据过滤、降维分群及可视化
22
CellChat细胞通讯(二)可视化篇
23
GWAS全基因组关联分析流程(BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel)
24
WGCNA分析,简单全面的最新教程(在线做,但也需要懂原理)
25
统计遗传学:第九章,GWAS+群体分析+亲缘关系分析
26
干货:把知识经验整理为电子书
27
如何在箱线图添加显著性--代码分享
28
ANNOVAR 软件用法还可以更复杂
29
3DSNP 数据库 | 注释 SNP 信息
30
使用FUSION进行TWAS分析
31
R包”gwasrapidd”------快速获取GWAS Catalog数据库的信息
32
连锁不平衡小工具-----LDlink的使用教程
33
🤩 CMplot | 完美复刻Nature上的曼哈顿图(一)
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干货:把知识经验整理为电子书

大家好,我是飞哥,参加工作七年了,写了很多博客,但是,博客,公众号,有很多不完美的地方,错别字,描述错误,方法错误。

有时候特别想把自己的知识体系系统的整理一下,把错误进行修改,这样别人检索到时能够不受错误的影响。

现在,Gitee的Page提供了电子书的可能,借助markdown和bookdown将md文件合并为网页版电子书,阅读体验很好。于是我将自己之前写的内容进行了整理,编写了四本电子书。

我相信一句话:如果你对某个事情不懂,就针对它写本书吧!

第一本:《R语言进阶笔记》

https://dengfei2013.gitee.io/r-language-advanced/

第二本:《plink软件操作教程》

https://dengfei2013.gitee.io/plink-cookbook/

第三本:《GWAS分析教程》

https://dengfei2013.gitee.io/gwas-data-analysis/

第四本:《统计遗传学教程》

https://dengfei2013.gitee.io/statistical-heredity/

Gitee不支持图库链接了,就买了一个阿里云的图库,后面继续更细的教程有(先立Flag)。

《GCTA操作教程》

《TASSEL操作教程》

《Admixture和Structure操作教程》

《混合线性模型育种中的应用》

《PGS和孟德尔随机化》

《分子标记辅助选择MAS》

《基因组选择GS》

……

以后介绍的领域还是固定的,毕竟吃饭的家伙还是这几个:生物统计,数量遗传,混合线性模型,生物信息,R,Perl,Python,GWAS,GS相关方法。

最后推广一下我的星球,微信问问题的多了,就没有时间回答,所以开通一个付费的星球,在里面会针对我熟悉的内容进行答疑,现在已经积累了54个精华帖,涉及到:育种模型、GWAS、GS和编程语言。

PS:

有个星球的老师,我回答问题后,非要额外给我微信发红包,我当然是不会要的,不过真的很感动,觉得自己的努力得到了认可。

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