掀开miRBase序列数据库新面纱

沉寂4年，miRBase终于在2018年3月12日发布了v22 版本。时隔四年，miRBase数据库究竟发生了怎样的变化呢？对我们的研究又会带来什么样的影响呢？来，让我们一起走近它，看看它的美！

miRBase序列数据库 (www.mirbase.org) 是关于miRNA全方位数据的一个重要公共数据库，提供了较全面的miRNA序列注释、预测基因靶标等信息供科研工作者免费使用。

数据量增多——新增序列超过1/3

本次更新最显著、最吸引人的变化当属收录数据的大幅增加。根据更新日志，本次更新新增物种多达48个，收录miRNA前体数量从V21版的28645提升到 38589条 ，同时还包括了271个物种的共48885个成熟miRNA产物。

新增物种中包含向日葵，丹参，黄瓜，草莓等研究中常用的植物，也包括水牛，穴兔，鸡等研究常见的动物。除此之外还增加了几十种病毒相关的序列，大大丰富了数据库的物种构成。

对V21的修订——我的miRNA哪去了？

类似参考基因组版本的更新，miRNA序列也在不断的更新。本次更新除了新增大量序列以外，也对上一版本已收录的许多序列进行了完善。完善的内容不仅包含修订miRNA的序列，还包含修订miRNA的id和删除不准确miRNA。想知道辛苦鉴定出来的miRNA 跟新版数据库是否能够对上，那就赶紧去瞅瞅新版miRBase 数据吧！

根据官方提供的miRNA.diff 修改记录，我们可以看到常见研究物种的更新情况：

数据集管理技术更新——更多更快更全！

V22中，miRBase可访问的深度测序数据集数量跃升至831个。miRBase发言人Sam表示,实际上有>1000个数据集等待添加，但是遇到了技术问题，正在努力解决。到时不仅能显著扩大miRBase中深度测序数据的视图，被归类为“高可信度”的microRNA注释数量也将显著增加。同时，为miRNA添加功能注释信息和序列检索的功能也正在开发中。相信这些新功能能够为广大研究者提供更多的帮助。

V22的面纱到这里就已经全部揭开啦，如果有想了解更多的小伙伴，欢迎在下方留言，我们的美女工程师会静候解答。。