版本速递-悟空数据分析平台第十三版

悟空平台第十三版来啦,来看下有哪些新功能~~

I. 对于平台还不是很熟悉的小伙伴可以看下下面的介绍:

II. 对于本平台的分析套路以及上传的数据形式说明可见:

III. 对于本平台最最基本的参数设置可见:

VI.关于悟空平台功能整体介绍可见文末说明。

这一路。。。

更新功能描述(详细操作后期会给出):

1. 新增代谢组学数据流程化处理[1-2],如下图所示:

该模块目前取名“串烧插线版”,其中包含原始数据导入---数据筛选---缺失值处理---数据质量控制(CV值,减弱批次效应,数据标准化)---假设检验---火山图---多元统计分析(常见的4A法:PCA、PLS-DA、OPLS-DA、HCA)---库匹配---通路富集分析。希望该模块能够帮助大家快速分析自己的数据,提高分析效率!

2. 新增自己上传GO背景库进行富集分析:

根据示例数据中的格式,上传自己的数据库,该模块就可以利用您自己上传的数据进行GO富集分析。

3. 画数值分布图模块:

这是小提琴图的一个变种,比如其可以展示某些基因在不同时间时的突变率变化,峰度越高表示突变率越大。

4. 稳定逻辑回归分析[3]:

这是相对普通逻辑回归的一种优化,其对一些异常特征不是那么敏感,仍然可以估算出对应的数值。

至此版本,本平台可以流程化处理蛋白质组数据和代谢组数据,把二者放在一起,咱们再来对比一下:

蛋白质组数据流程化处理过程

代谢组数据流程化处理过程

整体上看着两者的过程是不是很相近,没错,此二者整体框架基本类似,但是具体细节中又有一些不同。此外,需要着重说明的是:这些流程只是本人通过读文献以及平时自己处理数据的经验编辑而成,不是说数据分析一定按照这个流程走,开发这些工具也只是希望能够给大家带来方便,帮助大家快速高效地分析自己得到的数据,并且通过该平台,您也可以了解到都有哪些模型,相信其也是一个不错的学习平台。

若您在使用的过程中遇到什么问题或者发现哪些地方有错误,还请指正与回馈。

前路慢慢,求索不止。。。

参考资料:

【3】DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-642-04898-2_495

本人致力于打造一款国内较为实用的数据分析平台(http://www.omicsolution.org/wu-kong-beta-linux/main/),为广大国内有需求的小伙伴提供帮助,也感谢大家关注转发,以求帮助更多的人,谢谢

关注一下又不会怀孕,哈哈。。。

平台目前包含的工具(还在持续更新中...):

  • 发表于:
  • 原文链接http://kuaibao.qq.com/s/20171215G0NT4W00?refer=cp_1026
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