如何一步实现差异基因分析？

过了腊八就是年，基因云馆分析平台给大家提更“粥全粥到”的一步GEO服务。一个小时咱就能搞定的事情，大家不用再花费一两天的时间去研究了。下面由芸豆菌带领大家感受一下这个一步出结果的惊喜过程吧！

一步GEO

1、进入一步GEO界面，输入GSE编号（我们以GSE36001为例），点击查询，如图1、2所示：

图 1 一步GEO操作界面

图 2一步GEO操查询结果

2、选择分组 本案例Normal bone作为对照组CTR，而Osteosarcoma cell line作为疾病组DIS，点击CTR按钮，再点击具体的数据行，或者括选，之后同理选择DIS按钮，选择好分组后点击提交按钮，会自动完成GEOname和group填写，注意不要再做任何修改。选择完毕后，如图3、4所示，再点击位于下方的运行按钮：

图 3选择分组信息

图 4提交后的界面

3、差异基因 结果提交运行后，稍等一会就出结果，如图5、6展示：

图 5运行后的结果

打开结果中的html报告，如下图6：

图6结果报告

注意事项：

在使用一步GEO之前，事先在Genelibs平台上用GEO数据库检索模块检查一下，如果该模块可以检索出来结果（即，产生对应的html报告和RData文件且html报告有数据内容），再进行一步GEO分析。

另外，分组信息点选遇到困难时，可以换火狐等其他浏览器试试。

一步GEO优点：

省去了数据预处理的复杂操作和修改多组分组信息的步骤，方便快捷实现两两对比差异分析。