Planteome数据库:植物基因组和表型组数据共享平台

Planteome数据库是集成植物基因组学表型遗传学数据共享型平台。植物表型资讯简介如下。

温馨提醒:“第二届亚太植物表型国际会议”的早鸟注册日期是1231日。

Planteome数据库项目(http://www.planteome.org)为植物研究提供了大量的基础数据物种特异性本体模型,该平台基于共享概念模型,对数据格式进行了规范化处理,并对基因和表型关联分析提出一些注解。本体模型作为一种庞大且不断增长的数据集合研究,是集成植物基因组学、表型和遗传学数据的通用标准模型。可供参考的本体模型包括Planteome项目开发的植物本体、植物性状本体和植物实验条件本体,以及基因本体、生物兴趣化学实体,表型和属性本体等。此外,还包含来自世界各地的各种植物育种和研究团队开发的特定物种作物本体模型。Planteome数据库提供来自95个植物关于性状、表型、基因功能和基因表达等综合数据,并参考本体术语加以注释。该项目正在开发一个Planteome植物基因注释开发平台——Planteome Noctua,以促进各研究团队参与交流。所有Planteome本体模型都是公开可用的,并在Planteome GitHub站点(https://github.com/Planteome)进行维护,以便共享、跟踪和修订新的数据。注释数据可以从本体浏览器(http://browser.planteome.org/amigo)和数据存储库中免费访问。

Planteome的本体数据注释浏览器概述

(A)本体术语,(B)生物实体(C)注释

Planteome Noctua正在开发一个模型的视图

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  • 原文链接:http://kuaibao.qq.com/s/20171209G029F000?refer=cp_1026

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