本文继续介绍一些和概率统计相关的模拟。
前文《R-概率统计与模拟》介绍了一些用 R 进行概率模拟的实验,本文继续上次的工作,并在此过程中回顾一些相关的概率统计知识。
一共五题:
圆周率 pi 的值大家很早就知道了。其实我们可以用模拟的方法来自行估算。方法是:
按照上述方法,笔者写了一段随机产生点的代码:
产生的点如下:
从理论上计算:
用于模拟的代码是:
# Q2: 贝叶斯定理 obayes <- function() { x <- runif(1, min=0, max=1/3) y <- runif(1, min=0, max=1) ifelse(y < sin(pi * x), 1, 0) } sbayes <- function(n) { set.seed(SEED) res <- replicate(n, obayes()) mean(res) } SEED <- 123 N.bayes <- 1000000 sbayes(N.bayes) # simulative value: 0.477231 1.5 / pi # the theoretical value: 0.4774648
可以看出,当模拟的重复结果达到一百万次时,模拟的结果和实际值很接近。
另外,笔者还尝试另一种计算方式:
但是没有成功。如果有朋友找到计算 G(z) 的方法,希望能指导一下。
正如标题所说,模拟的任务就是看看多个独立并符合同一个正态分布的变量的平方和是否符合卡方分布。我们会尝试不同的变量数目进行模拟。
所以,这次会模拟出“多个独立并符合同一个正态分布的变量的平方和”这个变量的 c.d.f. 曲线。
用于模拟的代码:
# Q3: 模拟多个独立同分布(正态分布)变量的平方和(cdf) ochi <- function(n) { sum(rnorm(n) ^ 2) } schi <- function(n) { set.seed(SEED) res <- replicate(N.chi, ochi(n)) ecdf(res) } SEED <- 123 N.chi <- 10000 varNum.chi <- c(2, 3, 5, 10) lineCol <- c("red", "blue", "green", "black") res.chi <- sapply(varNum.chi, schi) plot(res.chi[[1]], do.points=F, verticals=T, col=lineCol[1], main="Simulation for quadratic sum of n i.i.d. variables\n(Normal distribution)") for (i in 2:length(res.chi)) { lines(res.chi[[i]], do.points=F, verticals=T, col=lineCol[i]) } legend("bottomright", legend=paste0("n=", varNum.chi), col=lineCol, lty=1, bty="n")
模拟出的 c.d.f. 曲线:
我们可以看看卡方分布理论上的 c.d.f. 曲线:
(图片引自网页https://wiki.mbalib.com/wiki/%E5%8D%A1%E6%96%B9%E5%88%86%E5%B8%83)
可以看出,模拟曲线和理论曲线很相像。
如同题目三,这次是看柯西分布的平均值。同样是看 c.d.f. 曲线:
模拟的代码:
# Q4: 模拟柯西分布的均值(cdf) ocauchy <- function(n, g) { mean(rcauchy(n, 0, g)) } scauchy <- function(n, g) { set.seed(SEED) res <- replicate(N.cauchy, ocauchy(n, g)) ecdf(res) } SEED <- 123 N.cauchy <- 10000 g <- 1 # Let Xi ~ C(g, 0). x.max <- 5 varNum.cauchy <- c(2, 3, 5, 10) lineCol <- c("red", "blue", "green", "black") res.cauchy <- sapply(varNum.cauchy, scauchy, g=g) plot(res.cauchy[[1]], do.points=F, verticals=T, col=lineCol[1], xlim=c(-x.max, x.max), main="Simulation for mean of n i.i.d. variables\n(Cauchy distribution)") for (i in 2:length(varNum.cauchy)) lines(res.cauchy[[i]], do.points=F, verticals=T, col=lineCol[i], xlim=c(-x.max, x.max)) legend("bottomright", legend=paste0("n=", varNum.cauchy), col=lineCol, lty=1, bty="n")
模拟的曲线:
可以看出:
马尔可夫链大家应该都很熟悉了。我们用一个小题目回顾一下:
用于模拟的代码是:
# Q5: 马尔科夫链(用四宫格模拟即可) MT <- matrix(c( 0.5, 0.2, 0.2, 0.1, 0.2, 0.5, 0.18, 0.12, 0.15, 0.25, 0.5, 0.1, 0.22, 0.18, 0.1, 0.5 ), byrow = T, nrow=4) powerOfMat <- function(M, n) { R <- diag(1, nrow=nrow(M)) for (i in 1:n) R <- R %*% M R } omarkov <- function(mt, k, start, end, nstep) { res <- start for (i in 1:nstep) res <- sample(1:k, 1, replace = T, prob=mt[res, ]) ifelse(res == end, 1, 0) } smarkov <- function(mt, k, start, end, nstep, N) { set.seed(SEED) res <- replicate(N, omarkov(mt, k, start, end, nstep)) mean(res) } SEED <- 123 startState <- 1 endState <- 3 nstate <- 4 nstep <- 10 N.markov <- 100000 smarkov(MT, nstate, startState, endState, nstep, N.markov) # simulative value:0.2512 powerOfMat(MT, nstep)[startState, endState] # theoretical value:0.2519698
可以看出,当模拟的重复次数到达十万次时,模拟值很接近理论值了。
从前文到本文,我们共通过八个小题目回顾了一些概率统计相关的知识,并尝试用 R 去做一些模拟,希望能对朋友们有所帮助。如果文中有任何错误,期望大家能指正!
本文分享自微信公众号 - 生信了(gh_ed36a29a9a9d),作者:hxj7
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原始发表时间:2019-10-10
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