生化小课 | 氨基酸序列提供重要的生化信息

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生化小课

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氨基酸序列提供重要的生化信息

对蛋白质中氨基酸序列的了解可以让我们深入了解蛋白质的三维结构、功能、细胞位置和进化。这些见解大多是通过寻找感兴趣的蛋白质与先前研究过的蛋白质之间的相似性而得出的。将新获得的序列与国际存储库中的序列数据进行比较，往往会揭示出既令人惊讶又具有启发性的关系。

我们不能详细准确地了解氨基酸序列如何决定三维结构，也不能总是从序列预测功能。然而，根据氨基酸序列的相似性，可以很容易地识别具有某些共同结构或功能特征的蛋白质家族。根据氨基酸序列的相似程度，单个蛋白质被分配到家族中。一个家族的成员通常有25%或更多的序列是相同的，这些家族中的蛋白质通常至少具有一些结构和功能特征。然而，有些家族是通过只涉及对某种功能至关重要的少数氨基酸残基的身份来定义的。许多类似的亚结构或“结构域”出现在许多功能不相关的蛋白质中。这些域通常折叠成结构配置，这些配置具有不同寻常的稳定性或专门用于特定环境。进化关系也可以从蛋白质家族的结构和功能相似性中推断出来。

某些氨基酸序列用作确定蛋白质的细胞位置、化学修饰和半衰期的信号。通常在氨基末端的特殊信号序列用于靶向某些蛋白质以从细胞中输出；其他蛋白质被靶向分布到细胞核、细胞表面、胞质溶胶或其他细胞位置。其他序列充当辅基的附着位点，例如糖蛋白中的糖基和脂蛋白中的脂质。其中一些信号已得到很好的表征，并且很容易在新表征的蛋白质序列中被识别。

Principles of Biochemistry

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