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社区首页 >问答首页 >R:导入data.table包命名空间，内存消耗中无法解释的跳转

问R:导入data.table包命名空间，内存消耗中无法解释的跳转
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Stack Overflow用户

提问于 2012-05-16 16:10:56

回答 1查看 2.9K关注 0票数 2

我在自己的包中使用data.table包，并在命名空间和描述文件中导入data.table命名空间。在我的一个函数中，我使用data.table函数将data.frame转换为data.table

dt <- data.table(df)

但是，当我调用我的函数时，在调用data.table()时，内存使用量立即跃升，而R只是停止响应。当我逐行运行并且内存消耗很低时，函数中的代码工作得很好。此外，如果我把库(data.table)放在我的函数中，一切都很好。我试图避免将库(data.table)放在函数中，而是声明依赖项。然而，似乎有什么问题是这样的。我在MacOSX10.6.8上运行R-2.14.0

有人能解释什么可能是原因吗?我如何解决这个问题(在我的函数中不使用库(data.table))？

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2012-05-17 01:02:21

一些没有特定顺序的随机猜测：

尝试仅在描述中使用导入或依赖字段。我不认为您也需要导入名称空间，但我可能错了。为什么这会解释为什么内存的使用，但不知道。

df是什么？它是大的，还是某种程度上的递归或奇怪的？如果可能的话，请提供str(df)来告诉我们一些情况。

试试as.data.table(df)，它比data.table(df)快。但听起来你的问题和那不一样。

您的函数调用是否被反复调用？我可以理解为什么反复将df转换为dt会耗尽内存，但并不是为什么只调用library(data.table)会使速度加快。

尝试使用R --vanilla启动R，以确保在启动时没有加载.Rdata (其中可能包括屏蔽data.table的函数)。如果您已经开发了自己的包，那么某种函数名称冲突，或者search()路径上的包顺序听起来是合理的。

否则我们需要更多的信息。我不记得有任何类似的事情发生在我身上，也没有被报道过。

那么，您使用的是哪个版本的data.table？在上的v1.8.1中有这个bug修复(还没有在CRAN上)：

将data.table安装代码从.onAttach移动到.onLoad，以便在简单地从包中import编辑data.table时也运行，修复#1916与缺少的data.table选项有关。

< code >f 223

但是，如果您使用的是CRAN的1.8.0，并且是导入(仅)而不是依赖，那么我希望您得到一个关于缺少选项的错误，而不是内存消耗的跳跃。

票数 3

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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/10628371

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