药物诱导性肝损伤（DILI）仍然是药物研发中最严峻的问题之一，不仅威胁患者安全，还导致临床试验失败和药物撤市。研究人员构建了 ToxPredictor，一个整合...

在哥本哈根举行的"衰老研究与药物发现"会议上，来自诺和诺德和礼来公司的两位演讲者提出了一个令听众振奋的观点：GLP-1受体激动剂（GLP-1s）——这类治疗肥胖...

研究人员提出了一种基于伪数据（pseudodata）的分子结构生成模型，用于探索真实世界中尚未被实验或数据库记录的未知化学物质。该方法通过从实验质谱谱图中自动构...

本文介绍一篇来自浙江大学谢昌谕和侯廷军团队联合乐普医疗团队发表的论文。该研究提出了一个深度融合合成规划的生成式流网络模型 SynGFN，能够在可合成化学空间中高...

研究人员提出了一个名为 RiboDecode 的深度生成优化框架，用于针对性地设计高效可翻译的 mRNA 密码子序列，从而显著提升蛋白表达与治疗效果。RiboD...

病理学是疾病诊断与治疗决策的核心环节，但传统诊断严重依赖显微镜观察，耗时且主观。深度学习虽在局部任务上取得显著进展，却仍受限于数据异质性与跨任务泛化不足。研究人...

在单细胞水平上测定蛋白丰度，有助于以高分辨率理解细胞过程和疾病进展中的生物学机制。然而，现有单细胞蛋白质组学技术面临覆盖度有限、通量受限、灵敏度不足、批次效应明...

通用人工智能模型在临床实践中应用于多模态数据和复杂任务时面临特殊挑战。研究人员提出了 MedMPT ——一种专为呼吸系统健康设计的多模态视觉–语言预训练模型。该...

单细胞测序技术极大地推动了研究人员对细胞异质性及其对环境刺激响应的理解。然而，系统地描绘多种细胞类型在不同刺激下的转录变化仍具挑战。研究人员提出 Squidif...

变异的不完全显现性（即携带致病变异但未表现出相应疾病表型）是遗传变异解释中的重大挑战。研究人员利用 Genome Aggregation Database (g...

以往针对大量靶序列与导向RNA（guide RNA, gRNA）的高通量CRISPR活性评估，多依赖插入–缺失突变（indel）频率而非切割效率。研究人员开发了...

本文作者：丁科炎（浙江大学）、喻靖（浙江大学）、黄俊杰（浙江大学）、杨宇晨（浙江大学）、张强（浙江大学）、陈华钧（浙江大学）

空间组学（Spatial Omics）的最新进展允许研究者对多个组学层（Omics layer）进行空间分辨率测量。然而受限于技术成本与通量，配对空间多组学技术...

研究人员提出了 Nicheformer，一种统一建模单细胞与空间组学数据的多模态基础模型。Nicheformer 在超过 3亿个细胞、数千个组织样本、百余种测序...

基因组注释模型能够直接分析DNA序列，对现代生命科学研究至关重要。研究人员将基因组注释问题重新定义为多标签语义分割任务，并提出了一种基于预训练DNA基础模型的细...

单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）为解析细胞发育轨迹和细胞命运决策提供了强大工具，但如何准确推断细胞发育潜能仍然是一项挑战。研究人员开发了 CytoTR...

临床计算器在医疗风险评估中发挥关键作用，但其应用往往受限于可用性、传播速度和临床整合度。研究人员提出了 AgentMD——一种能够自动搜集并应用临床计算器的智能...

蛋白–肽相互作用在信号转导、免疫调控和药物设计中具有核心作用。准确预测蛋白–肽复合物的结合构象与结合亲和力，是理解分子识别机制和推动肽类药物开发的关键。研究人员...

细胞即使处于相同的遗传背景和微环境中，也表现出明显的异质性，影响其形态、分子组成和功能。近年来，单细胞组学和空间组学技术的发展，使得研究者能够在分子和空间层面解...

单细胞蛋白质组学已广泛应用于当前生物医药研究，但其数据处理长期面临方法选择的困境。一方面，处理流程众多且性能高度地依赖于所研究的具体数据集，增大了对处理流程的选...