基因的转录由启动子和增强子等DNA调控元件控制，而这些元件的活性又受到多种转录因子的调节。由于其中涉及高度复杂的组合逻辑，长期以来一直难以构建能从DNA序列预测...

大语言模型（LLMs）为化学研究提供了新的发展机遇，包括研究规划、实验优化、数据分析、自动化执行和知识管理等方面。将LLM部署于活跃的环境中（即能与工具和数据实...

◉ HUDEP-2细胞在分化第0、4、8和12天的Cytospin图像。这些图像是10个独立实验的代表性样本。◉ 通过流式细胞术检测HUDEP-2细胞在分化前以...

当前蛋白质组基因组学在解析基因表达复杂性方面面临重大挑战。为此，研究人员开发了 moPepGen——一种基于图结构的算法，能够在保持线性计算复杂度的同时，全面生...

逆蛋白质折叠旨在生成可折叠为目标蛋白质结构的有效氨基酸序列。尽管近年来深度学习方法在该领域表现出强大潜力，但在预测具有高度结构不确定性区域（如无序区域）方面仍存...

【优质期刊】文献【泛读，精读】笔记。关注癌症，生信，多组学，数据库，科研工具，精准医学，临床研究，生物技术，计算机技能，大语言模型的应用。

人工智能（AI）正迅速变革制药行业，从靶点发现到精准医疗，全方位重塑行业格局，为加速药物研发与上市带来了前所未有的机遇。然而，尽管AI技术应用日益广泛，由AI赋...

研究人员引入了一种基于transformer的神经网络，在未注释的串联质谱（MS/MS）上进行自监督预训练，从MassIVE GNPS数据库中提取的GNPS实验...

2025年5月15日，Nature Reviews Drug Discovery上发表文章Is the FDA’s plan to phase out anim...

分子表示是本研究理解物质世界的关键要素，也是现代分子机器学习的基础。以往的分子机器学习模型通常使用字符串、指纹特征、全局特征以及简单的分子图，这些表示方式本质上...

细胞间通信（Cell‒cell communication, CCC）是维持生物系统协调运作的基本过程。越来越多证据表明，同一类型或簇群的细胞在不同微环境中可能...

在我们日常的网络使用中，我们或多或少都会遇到NAT（Network Address Translation）技术。它就像是一位隐形的网络守护神，默默地保护着我们...

在现代网络环境中，NAT (网络地址转换) 设备如同门卫一般守护着内网安全，但同时也形成了通信壁垒。据统计，超过 85% 的家庭和企业网络使用 NAT 设备实现...

免疫检查点抑制剂为肿瘤治疗带来范式变革，使得多种恶性肿瘤患者获益。然而，接受免疫检查点抑制剂治疗的患者中仅有10%-35%可以获得显著持久的治疗效果，亟需创新治...

大型语言模型（LLMs）因其处理人类语言和执行非特定训练任务的能力而备受关注。然而，研究人员对其化学能力尚缺乏系统性了解，这对于模型优化与风险控制至关重要。本研...

◉ a，TRADE 分析的示意图，从条件性的基因表达计数开始，到估计的 log2FC 分布结束。◉ b，各种模拟效应大小分布的估计（95% 为零的点正态分布，7...

◉ 免疫编辑与免疫逃逸之间的动态关系定义了肿瘤内异质性（ITH）。◉ 在肿瘤进化过程中，亚克隆获得的遗传和表观遗传改变导致了ITH。◉ 在免疫编辑的背景下，T细...

◉ a，TP53缺失的hTERT永生化视网膜色素上皮细胞（hTERT-RPE1TP53缺失，以下简称背景对照）中的突变积累实验。◉ b，CRISPR基因编辑的I...

◉ 研究设计的流程图。总共纳入了584名患有晚期非小细胞肺癌和中枢神经系统转移的患者作为初始队列。◉ 收集了与时间匹配的临床病理信息（n = 584）和影像学数...