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育种数据分析之放飞自我

生物统计, 数量遗传学, GWAS, GS
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一个批量做LDblock的脚本
今天,有小伙伴在星球询问GWAS分析的显著性位点,如何批量绘制LDblock,之前写过LDblock的安装和使用说明:(LDblock绘制连锁不平衡和单体型图)
邓飞
2024-05-29
1130
数据分析师吃饭的家伙介绍:硬件和软件
大家伙,我是飞哥,前几天介绍了一下三屏幕的快乐(三个屏幕的快乐是真快乐),后台有人问相关的配置和价格,今天分享一下我办公常用的硬件和软件。
邓飞
2022-05-19
4250
Excel格式的SNP数据怎么变为plink格式
有时候,我们会遇到Excel格式的基因型数据,这篇博文介绍一下如何手动转为plink格式。
邓飞
2022-05-19
1.6K0
GCTA学习3 | GCTA的两篇NG:fast-LMM和fast-GLMM
GCTA在2010年首次释放,现在的版本是1.94.0beta,2021年到现在更新了3次,重要的更新时增加了fastGWA、fastGWA-GLMM,相关文章发表在NG上。
邓飞
2022-02-09
6710
git | Windows下如何利用Linux的命令
在windows下,我也想用awk,sed,grep这Linux的三剑客,怎么办?之前我时安装的cywin软件,很麻烦,而且界面不好看,用着不方便。有没有方便一点,简单一点的软件呢?
邓飞
2020-10-23
2.4K0
shell 脚本 for循环中镶嵌nohup 后台执行
平时工作中,主要任务是改代码,然后才是写代码,很多代码可以复用,很多分析可以批量进行。今天介绍一下在Linux下批量执行代码的方法。复杂的可以用snakemake编写定义规则,简单的用shell直接写就可以。
邓飞
2019-09-04
4.9K0
如何高效的在服务器和本地进行上传和下载文件
昨天, 师弟告诉我可以在xshell中使用sz进行下载, 想要上传的话用rz就行了. 然后我竟然没有听过. 学习最好的方法就是写一篇博客, 比如这篇.
邓飞
2019-06-13
3.7K0
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