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育种数据分析之放飞自我

生物统计, 数量遗传学, GWAS, GS
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植物碰撞动物的火花--数据分析进阶
本来,植物育种的数据分析都是随机区组、增广试验、空间分析之类的,当碰到动物育种的领域,系谱信息、个体动物模型就出来了,更别提多性状模型、基因组选择、基因与环境互作,这些都是进阶的内容。
邓飞
2022-12-12
4280
学习一个PPT:育种中混线性模型的应用
可以看出,GS的方法比传统系谱的方法准确性要高。对于一些甚至系谱也没有应用,只靠家系或者表型选择的中低遗传力性状,GS呈现碾压式优势。所谓的降维打击既是如此。
邓飞
2019-12-19
8460
读文献:全基因组选择模型进展及展望
随着全基因组选择统计模型的不断改进优化,模型的稳定性及准确性不断提高,但是依然面临两个重要的挑战,即计算准确性和计算效率;直接法(GBLUP为代表)计算效率较高,但是计算准确性略差于间接法(BayesB为代表),虽然学者对直接法进行了改进,但是由于改进的策略中人为设定参数较多,因此模型的预测准确性受主观因素影响较大;间接法计算准确性较高,但是由于参数求解过程中计算量庞大,且无法实现并行运算,而育种讲求时效性,所以难以高效指导育种实践;因此,如何优化模型,尽可能减少人为设定参数,与机器学习方法有效结合,并融入高效可并行运算,既能保证较高准确性的同时,大大提升计算效率,是未来全基因组选择模型优化的方向。
邓飞
2019-12-05
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