问kableExtra:无法保存带有数学表达式的HTML表&无法在Latex表中显示
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Stack Overflow用户

提问于 2021-12-01 16:59:25

回答 1查看 168关注 0票数 1

我希望将R中的表保存为图像，其中包括列名中的数学表达式和kableExtra中spec_hist()函数中的内联直方图。理想情况下，我希望将表格式化为Latex表，但HTML也会这样做。

我遇到的问题是，当我尝试保存一个可使用的表时，数学表达式没有得到正确的解释，但是内联直方图显示得很好。

同时，如果我试图保存一个可使用的Latex表，数学表达式将被正确地解释，但是直方图将不会出现。

这可能是一个bug (两个bug)吗？在kableExtra？还是我漏掉了什么？

注意，在R/R中，可使用的HTML表看起来非常好(数学表达式和内联图)。但是我想保存这个图像的重用。然而，可使用的Latex表从不显示内联直方图，无论是显示在R中还是保存到文件中。

下面是一个可重复的例子：

library(knitr)
library(kableExtra)

df <- mtcars[1:6,] %>% 
          mutate(`$\\theta_{boot}$` = "") %>% # add an empty column where the in-line histograms will go
          rename(`$mpg$` = mpg, # rename some columns to math expressions
                 `$\\bar{cyl}$` = cyl, 
                 `$\\bar{disp}$` = disp,
                 `$hp$` = hp, 
                 `$drat$` = drat)

# create dummy data for the in-line histograms
hist_dat <- list(runif(20), runif(20), runif(20), runif(20), runif(20), runif(20))


# Make HTML Table
kbl(df, escape = FALSE, booktabs = T, format = "html") %>%
  add_header_above(c("Some Header" = 6, "Some Other Header" = 7)) %>% # add header
  kable_styling(latex_options = c("repeat_header"), font_size = 12) %>%
  column_spec(12, image = spec_hist(hist_dat)) %>% # add in-line hist
  pack_rows("Group 1", 1, 3) %>%
  pack_rows("Group 2", 4, 6) %>%
  kable_paper() %>%
  as_image(file = 'temp.png')
  #save_kable(file = 'temp.png')

上面的内容保存了这个图像：

柱状图在那里，但是列名被打印为文字而不是解释的数学表达式。

现在是Latex版本：

# Make Latex Table
kbl(df, escape = FALSE, booktabs = T, format = "latex") %>%
  add_header_above(c("Some Header" = 6, "Some Other Header" = 7)) %>% 
  kable_styling(latex_options = c("repeat_header"), font_size = 12) %>%
  column_spec(12, image = spec_hist(hist_dat)) %>%  
  pack_rows("Group 1", 1, 3) %>%
  pack_rows("Group 2", 4, 6) %>%
  kable_paper(full_width = TRUE) %>%
  as_image(file = 'temp_latex.png')
  #save_kable(file = 'temp.png')

使用format = "latex“和full_width = TRUE生成以下文件：

现在正确地解释了列名，但没有绘制直方图。

我还发现，无论我是使用as_image()还是save_kable()来保存图像，都没有区别。

有什么想法吗？

谢谢!

编辑:硬件说明:我在Mac上安装了LaTeX。图形工作正常，尽管所有涉及latex的调用在我的Windows机器上都失败了(相同的代码、MikTeX、Ghostscript和Magick安装)。

> R.version
               _                           
platform       x86_64-apple-darwin17.0     
arch           x86_64                      
os             darwin17.0                  
system         x86_64, darwin17.0          
status                                     
major          4                           
minor          1.0                         
year           2021                        
month          05                          
day            18                          
svn rev        80317                       
language       R                           
version.string R version 4.1.0 (2021-05-18)
nickname       Camp Pontanezen