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生信宝典

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视频 | 学习Linux进行GTF解析

容器镜像服务 linux unix bash bash 指令

5.2 如何获取目标基因的转录因子（上）——biomart下载基因和motif位置信息

2022-11-29

1.3K0

我被跨系统的换行符折磨疯了~~~

linux unix perl windows

不同的操作系统使用的换行符不同，如 Windows 使用的换行符是\r\n (回车+换行), Unix/Linux使用的换行符是\n (换行)，Mac 使用的换行符是\r (回车)。

2022-04-19

2.2K0

这21个不太好搜索其含义的特殊符号你都知道吗？

编程算法 grep linux bash bash 指令

Linux命令中有一些常用符号，看到时不一定好查询它们的功能和含义，这里列举一些常见的符号和解释，欢迎大家补充完善。

2022-03-27

7900

竟然被awk生成的随机数给整蒙了，也谈随机数生成种子

数据库 sql unix linux 腾讯云测试服务

我们现在主要的一个业务是给科研单位等提供数据库构建服务，目前承接的数据库已经发表了3篇NAR文章，具体见你的数据也可以-三篇NAR的数据库。

2022-03-25

6080

JGG：青岛大学苏晓泉团队利用条件致病菌指数评估环境微生物风

评估环境中条件致病菌的风险程度并了解其传播途径是公共健康中最为重要的环节之一。之前研究虽然已经发现针对特定疾病的微生物标记，并建立基于微生物组的诊断方法，但对复杂微生物组群落致病性的全面综合量化（例如，致病菌总体含量、致病菌类型、疾病类型等），仍然缺乏高效的生物信息分析手段。此外，微生物组研究通常以整体菌群作为考察对象，会掩盖菌群中有特殊功能的子类群（比如条件致病菌）的独特功能。因此亟待开发和完善相关生物信息方法以解决上述问题。

2022-03-25

3200

这篇文献总结了常见的中式英语写法，来看看有没有中枪？

linux javascript 编程算法图像处理 ide

The Most Common Habits from more than 200 English Papers written by Graduate Chinese Engineering Students

2022-01-19

4100

MEGA | 多序列比对及系统发育树的构建

linux alignment data edit sequence

MEGA是一个用于多序列比对和可视化、以及构建系统发育树的免费程序。自1993年发布以来，MEGA共更新9个版本 (没有第八、九版)，今年发布的MEGA 11为处理更大的数据集进行了优化。

2022-01-19

6.2K0

速查表 | Bash cheat sheet!

linux 网站 bash shell bash 指令

Here, we list some basic bash syntax with a brief explanation. It is a good starting point if you are a beginner.

2022-01-19

2250

Time除了监控程序运行时间还能干这个？

https 网络安全编程算法 linux bash

那如果我们想监控程序的运行内存怎么办？我们可以调用系统的time，而不是bash的time，什么区别呢？

2022-01-18

2600

统计测序数据reads数和碱基数的几种方法

更详细的介绍和安装见推文seqkit：序列梳理神器-统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等30项全能。

2022-01-18

1.9K0

这些21个不太好搜索其含义的特殊符号你都知道吗？

linux 编程算法 grep

Linux命令中有一些常用符号，看到时不一定好查询它们的功能和含义，这里列举一些常见的符号和解释，欢迎大家补充完善。

2022-01-18

9140

无代码调整聚类热图分支顺序

聚类热图根据不同的聚类算法和距离计算方式，获得的热图分支结构会有一些不同。有时，我们也希望能在不改变分支结构的基础上，对热图分支的顺序进行一些调整，这就是推文聚类热图怎么按自己的意愿调整分支的顺序？的出发点。

2022-01-18

7490

这个40M的小工具助你在windows下处理数据如虎添翼！！

git windows linux bash bash 指令

NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step)）、批次效应处理等内容。

2021-11-08

1.1K0

哈佛大学单细胞课程|笔记汇总（九）

对于上面提到的3个问题，我们可以使用Seurat探索3种不同类型的标记识别来解答。每种都有自己的优点和缺点：

2020-11-24

3.6K0

微生物组—宏基因组分析专题研讨会(2020.2)

数据分析 linux 大数据 r 语言

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2020年2月14-16日，北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第七期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+再集中讲解答疑+上课视频回看反复练习)，“教—练—答—用”四个环节统一协调，真正实现独立分析大数据。

2019-12-25

1.4K0

PATH和path，傻傻分不清

linux anaconda python windows

习惯了Windows电脑下的所见即所得，找到程序或文件双击即可运行或打开；于是我们被惯得以为电脑会像人一样聪明，给他一个名字就可以运行程序或打开文件；于是在命令行下或程序里不断碰壁，为啥这个命令不运行了呢？

2019-12-12

1.9K0

知道肠道菌种组成之后怎么做功能注释？

数据分析大数据 linux r 语言

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年11月1-3日，北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第六期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+再集中讲解答疑+上课视频回看反复练习)，“教—练—答—用”四个环节统一协调，真正实现独立分析大数据。

2019-10-10

2.3K0

从一段挖矿病毒代码看Linux命令的实际应用

linux 区块链网络安全 bash bash 指令

最近做易生信培训时新购了一块阿里云，用于演示分析流程搭建和配置。短期使用，上面没有数据，也没做什么防范，结果不曾想，被挖矿病毒盯上了，给了一个近距离接触病毒的机会。

2019-07-12

6.5K1

原来Rstudio还可以这么使用，又方便了一些

在别人的电子书，你的电子书，都在bookdown中我们讲述了bookdown用于自动化文档生成。里面涉及到一个文件Rproj用于项目管理。

2019-05-24

2.5K0

跟NBT一作学扩增子分析 | 2019微生物组—16S扩增子分析专题研讨论会第五期

数据分析腾讯云开发者社区 linux r 语言

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年7月19-21日北京推出《16S扩增子分析》专题培训第五期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子分析实战学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+集中讲解答疑+上课视频回看反复练习)，“教—练—答—用”四个环节统一协调，真正实现独立分析大数据。

2019-05-14

1.5K0

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