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为什么M1芯片的Mac电脑反而不能安装针对它的特殊定制化软件
java
硬件开发
jdk
arm
oracle
因为苹果电脑最近全面抛弃了传统的x86的64位芯片架构,转向了M1芯片是Arm 64 ,就比较麻烦。如果你有的M1芯片的Mac电脑,你肯定是会选择jdk-19_macos-aarch64_bin.dmg ,因为 它可以顺利安装。如果你一定要下载jdk-19_macos-x64_bin.dmg ,理论上你的电脑也会拒绝安装。
生信技能树
2022-12-16
1.3K
0
Java软件相关运行环境到底是jdk还是jre
jdk
https
网络安全
java
但是如果你电脑缺Java环境,你第一时间去搜索解决方案的时候,往往会有一个疑问:Java软件相关运行环境到底是jdk还是jre:
生信技能树
2022-12-16
557
0
为何cytoscape总是说我没有java呢
java
jvm
https
jdk
网络安全
因为最近自己购置了一个全新的Windows电脑,所以就系统性的配置了全部的生物信息学相关软件,当然是也包括cytoscape啦。但是遇到了报错,如下:
生信技能树
2020-07-30
2.3K
0
使用MiXCR进行免疫组库分析
数据库
sql
java
https
网络安全
接下来又认识了免疫组库测序数据,知道了免疫组库测序数据的一些特性,并且使用igblast进行免疫组库分析了,但是那个是初步的比对,虽然找到每一个测序片段的V,D(可选),J,C基因,并且拿到 CDR3序列,中间步骤有点多,常规的测序数据过滤就算了,还需要把PE数据合并,fastq格式转为fasta格式,而且本身igblast软件就很难使用,数据库文件构建也繁琐。其实也有包装好的一站式流程。
生信技能树
2020-06-03
2.7K
0
使用aspera从EBI下载fastq数据,抛弃NCBI的SRA数据库吧!
ftp
https
网络安全
java
ENA主页:https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
生信技能树
2020-02-20
9.3K
3
找寻gvcf失败的原因(java啊java,配置啊配置)
java
编程算法
因为我只想保留recal后的bam和,call出来的gvcf文件,但是发现有些样本根本就走不通这个流程,就需要debug了。
生信技能树
2019-11-21
1.3K
0
在Ubuntu18安装rJava
linux
ubuntu
java
命令行工具
既然报错日志指出来了我们应该使用root权限,运行命令:R CMD javareconf
生信技能树
2019-11-20
815
0
把含有多样本的vcf文件拆分
http
ios
java
打包
非常多已经造好的轮子可以完成,包括bcftools,vcftools,还有大名鼎鼎的GATK,随便举例如下:
生信技能树
2018-09-21
3.2K
0
GATK4的CNV流程-hg38
https
github
java
至少gatk-4.0.2.1.zip无法走CNV流程,我重新下载了目前最新版的才能顺利运行:
生信技能树
2018-07-27
5.3K
0
终于看到了一个完整的mutect2使用脚本
java
数据分析
因为嫌麻烦,所以一直使用的是简化版mutect2流程,其实就一个命令: time $GATK --java-options "-Xmx10G -Djava.io.tmpdir=./" Mutect2 -R $reference \ -I $tumor_bam -tumor $(basename "$tumor_bam" _recal.bam) \ -I $normal_bam -normal $(basename "$normal_bam" _recal.bam) \ -O ${sample}_mut
生信技能树
2018-07-27
1.9K
0
GSEA分析一文就够(单机版+R语言版)
r 语言
数据库
java
通过前面的讲解,我们顺利的了解了GEO数据库以及如何下载其数据,得到我们想要的表达矩阵,但,这只是分析的开始,最经典的分析就是GSEA了,看看基因全局表达量的变化是否有某些特定的基因集合的倾向性。 历史目录: 解读GEO数据存放规律及下载,一文就够 解读SRA数据库规律一文就够 从GEO数据库下载得到表达矩阵 一文就够 GSEA软件的用法 这个是java软件,所以各个电脑操作系统都可以很容易安装及使用。我在生信菜鸟团博客也手把手讲解了详细操作过程,这里就不再赘述咯: 用GSEA来做基因集富集分析 http
生信技能树
2018-03-29
6.1K
0
没有更多了
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【纪录片】中国数据库前世今生
穿越半个世纪,探寻中国数据库50年的发展历程
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