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生信技能树

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Python也能画漂亮的complex heatmap?
对于经常用R语言来画图的科研工作者来说,应该对ComplexHeatmap(https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/)很熟悉了吧。这个包画的热图,既专业又漂亮。
生信技能树
2023-02-28
1K0
使用rvest从COSMIC中获取突变表格
在学习如何爬取网页之前,要了解网页本身的结构。 用于构建网页的主要语言为 HTML,CSS和Javascript。HTML为网页提供了其实际结构和内容。CSS为网页提供了其样式和外观,包括字体和颜色等细节。Javascript提供了网页功能。在此,我们将主要关注如何使用R包来读取构成网页的 HTML 。
生信技能树
2022-04-14
1.9K0
可视化单细胞亚群的标记基因的5个方法的升级版
但是真实数据分析有时候需要个性化的图表展示,也就是说这5个函数不仅仅是要调整很多参数,甚至需要自定义它们,让我们来看看示例:
生信技能树
2021-12-27
2.1K0
CancerSCEM: 人类癌症单细胞表达图谱数据库
一个包含人类多种癌症的scRNA数据库CancerSCEM,除了常规的分析之外,还提供网站可视化和在线分析(https://ngdc.cncb.ac.cn/cancerscem)
生信技能树
2021-12-16
9810
使用bowtie2和samblaster一步到位的干净比对
运行速度很慢,现在有高效工具啦,比如sambamba主要有filter,merge,slice和duplicate等七个功能来处理sam/bam文件,几乎可以替代 samtools啦,不过,这里要着重介绍的是samblaster
生信技能树
2019-07-26
2.6K0
分组计算描述性统计量函数—by()函数
简单点说by(data, INDICES, FUN)函数的典型用法: 是将data数据框或矩阵按照INDICES因子水平进行分组,然后对每组应用FUN函数。 是不是没懂?反正看完后我没懂~
生信技能树
2019-05-24
1.1K0
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