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生信技能树——TCGA癌症数据1
nat
NAT 网关
因为是癌症方面,自己不研究这一方面,所以不常用,但是GEO的转录组数据,是根据这个文件改写的
生信技能树
2022-06-08
850
0
胡萝卜的长非编码RNA的鉴定
nat
NAT 网关
数据分析
12个样本:2个基因型(紫色和橙色胡萝卜)X 2个组织(木质部和韧皮部)X 3个生物学重复。
生信技能树
2021-07-06
479
0
同样的单细胞研究,为什么发表的文章杂志等级差别那么大
express
linux
nat
NAT 网关
让我想起来了另外一个COVID-19病毒感染病人的单细胞研究,发表在Cell Discov. 2020 May ,标题是:Immune Cell Profiling of COVID-19 Patients in the Recovery Stage by Single-Cell Sequencing,差不多是同一时间发表的哦!
生信技能树
2020-06-28
674
0
多位点取样外显子测序看食管癌的肿瘤内部突变异质性(逆向收费读文献2020-15)
对象存储
nat
NAT 网关
本研究发表于 Nat Commun. 2019 Apr ,题目是:Multi-region sequencing unveils novel actionable targets and spatial heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma. 纳入 39个ESCC病人,然后取肿瘤样品 185个,146个原位癌症样品和21个淋巴结转移样品。不仅仅是肿瘤外显子测序,还有一些TCR测序。
生信技能树
2019-07-05
787
0
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