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生信技能树

专栏作者
1914
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1134
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小白windows系统从零开始本地部署大模型全记录
具体参考这条帖子: https://zhuanlan.zhihu.com/p/655948272
生信技能树
2024-04-13
7850
雕虫小计与奇技淫巧
大家好,我是一个不愿透露姓名的生信技能树2023年02月课程的学员O(∩_∩)O。
生信技能树
2023-02-27
1.5K0
成为完整的生信工程师必须补全Linux技能
如果这里面确实没有你需要的NGS技术,你需要做的仍然是看完我这些视频,搞清楚我是如何学习一个ngs技术的,然后把这个技能迁移到你自己的ngs数据。你会发现,万变不离其宗,本质上都是Linux能力,如何在服务器里面配置和管理软件,如何看各个软件说明书文档。
生信技能树
2022-07-26
8230
在Mac或者Linux上面安装velocyto.R的成功经验分享
不过,除了服务器,我也在自己的苹果电脑上面试了试,在Mac操作系统还是蛮简单的,本来应该是就一句话安装啦:
生信技能树
2022-07-26
1.3K0
RNA-seq入门实战(零):RNA-seq流程前的准备——Linux与R的环境创建
连续两次求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,以及 生信技能树知识整理实习生招募,让我走大运结识了几位优秀小伙伴!大家开始根据我的ngs组学视频进行一系列公共数据集分析实战,其中几个小伙伴让我非常惊喜,不需要怎么沟通和指导,就默默的完成了一个实战!
生信技能树
2022-06-27
2.2K0
通过R里面的reticulate包桥接使用Windows的conda
但是我们常规的的教程都是基于Linux的conda的教程,比如各个用户里面安装自己的conda,每个用户独立操作,安装方法代码如下:
生信技能树
2022-03-03
1K0
适当清理你的微信聊天文件
这样就有一个问题,它的默认C盘是一个固态硬盘就区区500G空间,但是我微信等很多软件都是默认在C盘自己的用户下面的文档文件夹里面找位置存放资料。
生信技能树
2022-03-03
1.4K0
在非Linux系统的电脑也可以使用命令行工具操作R语言
而在个人电脑,通常是Mac或者Windows,都是直接使用界面版本的rstudio更方便的交互式使用R语言。交互式的好处是所见即所得,每个代码随时响应随时看到效果,尤其适合各种各样的统计可视化需求。
生信技能树
2021-10-12
1.2K0
Y叔的clusterProfiler承包了富集分析结果的可视化
见Y叔的网络在线书籍《clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study》的 Chapter 12 Visualization of Functional Enrichment Result , 自己简单搜索就可以直达这个在线书籍的链接:
生信技能树
2021-07-29
1.6K0
底层架构真的折磨死个人(急,在线等)
本来是4~8个小时就可以跑完的,在Windows的内置ubuntu子系统运行了30个小时还看不到希望,果断杀掉进程!
生信技能树
2020-08-07
1.5K0
为什么R4.0版本内置的R包那么多
很轻松就可以在 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 看到最新版R语言,安装它后,再配套rstudio打开即可:
生信技能树
2020-07-30
7720
clusterProfiler到底有多难安装呢
但是最近频繁看到粉丝留言表明安装clusterProfiler包失败,这个clusterProfiler是大名鼎鼎的Y叔开发,基本上是每个做生物信息学数据分析的人都会使用它的,做超几何分布检验(富集分析),而且内置了很多数据库,好用的函数。
生信技能树
2020-07-30
3.5K0
windows的Ubuntu子系统ssh和ftp
但是很多时候,我们可能并没有Linux服务器,这个时候其实自己的个人电脑也可以勉强成为Linux服务器:
生信技能树
2020-07-29
3.5K0
学员分享-aspera踩坑记录
19年开学的时候是打算自学,偶然间发现生信技能树,然后在b站上看了生信技能树的视频,基础不够,看了一部分R语言的相关视频就没有继续看下去了。我在天津上学,一开始还想等生信技能树来天津然后报线下课,由于这次疫情的我,有机会上了线上班。我是第五期学员,现在已经是上完课的状态,虽然自己上完课了依旧很菜,但是至少让我有勇气,有底气觉得自己有一点点入门的希望,有可以让自己继续学下去的勇气。也把如此好的课程推荐给大家,生信技能树官方举办的学习班:
生信技能树
2020-07-21
1.9K0
遇事不慌,控制变量法帮助你
学习过TCGA数据挖掘课程的朋友们都应该是知道,可以使用GDC工具来进行TCGA数据下载,首先需要下载一个编译后的二进制可执行的GDC工具软件文件,简单的bing搜索就可以找到官方链接,如下:
生信技能树
2020-06-28
5110
信息熵的4个量化指标的R代码实现
国际惯例把0.2以下视为收入绝对平均,0.2-0.3视为收入比较平均;0.3-0.4视为收入相对合理;0.4-0.5视为收入差距较大,当基尼系数达到0.5以上时,则表示收入悬殊。
生信技能树
2020-05-26
1.5K0
【紧急通知】下载R包却联网失败?初学者的痛
我们给出来的解决方案,仍然是;之前研发好的 url.method 这个配置的解决方案;
生信技能树
2020-04-14
9260
生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)
在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面,我提到过Linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的,哪怕你现在搜索到十几年前的Linux教学视频,也不会觉得尴尬。而且Linux属于IT工程师必备技能,IT的发展程度远超于我们,再加上各种马哥鸟叔,还有黑马训练营公开30天完整教学视频,按照道理我是没有必要在他们IT专业人士面前班门弄虎的, 毕竟他们随便拿几个偏门知识点就可以问倒我了!不过我们生信技能树的特色是主打生物信息学方向技能建设,而它作为一个典型的教交叉学科,想在此领域成为一个专业靠谱的生信工程师,我们实在是做不到在任何一个非核心知识点投入过多的时间和精力。
生信技能树
2019-09-17
3.6K0
使用R语言展示我们生信技能树全国巡讲的征程
两个月过去了,又去了几个城市,图该更新了,这可咋办。向来不喜欢走回头路,于是就另寻他法了。 胡乱搜索一下,发现R语言可以做!
生信技能树
2019-08-20
8330
R包降级也不全是那么简单
下载安装Rtools,一次性安装到C盘(必须是C盘哦),再打开Rstudio运行packages的安装代码即可。
生信技能树
2019-07-30
1.1K0
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