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使用jupyter notebook运行python和R
jupyter notebook
开源
r 语言
python
一个图形化的交互式运行环境，对于编程语言的学习和开发，特别是可视化方面，提供了极大的便利。比如在window上使用R语言进行绘图，在R语言自带的交互环境中，可以实时观测到代码的可视化效果，从而方便的进行参数调整。
生信修炼手册
2020-07-16
2.2K
0
初识pandas
python
numpy
r 语言
数据分析
pandas基于numpy进行开发，是python数据分析的核心包，针对结构化数据，提供了一系列灵活且强大的数据分析功能。在pandas中，提供了以下两种基本的数据结构
生信修炼手册
2020-06-24
529
0
基于家系数据的GWAS分析
r 语言
面向对象编程
通过GWAS分析可以寻找与某一疾病或性状相关的突变位点，传统的GWAS都是基于control/case的设计，通过比较健康人群和患病人群中突变位点或者基因型频率的差异，最终确定相关的位点。
生信修炼手册
2020-05-11
1.2K
0
IBS在遗传分析中的运用
r 语言
数据分析
IBD 全称 Identity By Descent, 又叫做血缘同源，指的是两个个体中共有的等位基因来源于共同祖先；IBS全称Identity By Descent, 又叫做状态同源，指的是两个个体中共有的等位基因序列相同。
生信修炼手册
2020-05-11
4.2K
1
采用igraph包分析网络数据
编程算法
聚类算法
unity
r 语言
对于网络的可视化和数据挖掘，有很多图形界面的软件可供选择，比如cytoscape, gephi 等等，这些软件使用方便，操作简单，功能的强大，但是同时也有着一个缺点，就是无法自动处理，只能通过人工点击鼠标来操作，对于大批量数据的分析而言，依靠人工费事费力。
生信修炼手册
2020-05-08
4.1K
0
R语言也可以进行ATAC数据的完整分析啦！
r 语言
python
数据分析
个人认为，R语言有两个强项，统计和绘图。在生物信息数据分析中，R语言更多时候是发挥一个科学计算和可视化的作用。当然，R语言的功能远不止于此，不仅可以作为脚本语言，解决统计分析和可视化的”小”问题，也可以编写一套完整pipeline, 解决整套数据分析的”大”问题。
生信修炼手册
2020-05-07
1.1K
0
annoPeakR:一个peak注释的在线工具
r 语言
annoPeakR是一个peak注释工具，基于R语言中的shiny包开发出的web应用，网址如下
生信修炼手册
2019-12-19
1K
0
自己动手进行逻辑回归，你也可以！
r 语言
作为最广泛使用的关联分析工具，plink支持卡方检验，费舍尔精确检验，逻辑回归，线性回归等多种分析方法，用法简单，运行速度快。使用plink进行case/control逻辑回归, 只需如下所示的一句代码
生信修炼手册
2019-12-19
1.5K
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