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《数据可视化基础》两个或多个连续性变量相关可视化(一)
生物基因
数据库
以下部分是基于《Fundamentals of Data Visualization》学习笔记，要是有兴趣的话，可以直接看原版书籍：https://serialmentor.com/dataviz/
医学数据库百科
2020-08-27
1.5K
0
《数据可视化基础》第11章：两个或多个连续性变量相关可视化(一)
生物基因
很多数据集里面都包含有两个或者更多的连续性变量，有时候我们比较感兴趣这些变量之间存在什么相互作用关系。例如，我们可能有不同动物的量化测量数据集，如动物的身高、体重、长度和每日能量需求。为了绘制仅仅两个这样的变量的关系，例如身高和体重，我们通常会使用散点图。如果我们想一次显示两个以上的变量，我们可以选择气泡图、散点矩阵或相关图。最后，对于非常高维的数据集，执行降维可能是有用的，例如以主成分分析的形式。
医学数据库百科
2020-08-27
624
0
TCGAG多组学联合分析数据库
生物基因
之前我们在介绍GEPIA的时候，说这个数据库只能用于TCGA表达数据的一些分析。但是对于TCGA数据而言，里面包括相同样本的表达、突变、拷贝数、甲基化以及临床信息等数据，所以我们其实可以利用TCGA数据库来进行多组学之间的交叉分析。今天我们就介绍一个TCGA多组学分析的经典数据库:
医学数据库百科
2020-08-27
935
0
肿瘤转移相关lncRNA数据库
生物基因
实验验证的数据库数据库其实和综述差不多。综述是基于一个主题检索相关文献，然后利用文字来进行来进行总结出这些文献的相关特点。而这类经过实验验证的数据库，第一步也是人工来检索相关的文献。第二步则把文献当中的相关信息，通过数据库的形式来呈现出来。这样的好处是我们可以得到作者作用检索的信息。
医学数据库百科
2020-08-27
974
0
突变对蛋白功能影响预测
生物基因
在每个分析开始之前，我们都需要命名一个数据的ID。这个ID可以让我们以后，如果想要继续查看结果的话，直接在Job Queue里面输入ID即可。
医学数据库百科
2020-06-01
2K
0
蛋白功能预测
生物基因
我们在遇到一些新的蛋白的时候，经常需要去了解这个蛋白的功能。如果是一个新的还没有功能注释的蛋白，一般数据库就用不了了。这个时候就可以使用 NetGo 来对蛋白的序列进行功能注释了。
医学数据库百科
2020-06-01
810
0
融合基因功能预测数据库
生物基因
昨天我们介绍的融合基因查询的数据库，可以查询发生基因融合的基因。由于发生了基因融合，所以就相当于形成了新的基因，对于这种基因的功能是什么，昨天的数据库没有介绍。今天我们就来介绍用来查询融合基因功能的数据。
医学数据库百科
2020-06-01
765
0
基因融合检测数据库介绍
生物基因
基因融合指的是两个或者多个基因的部分序列结合到一起形成了一种新的基因。随着高通量测序的发展，我们可以利用二代测序的数据来鉴定出发生在不同疾病当中的融合基因，所以也就出现了很多来寻找融合基因的数据库。今天就来给大家介绍几个融合基因查询的数据库。
医学数据库百科
2020-06-01
1.7K
0
蛋白质相互作用数据库
生物基因
关于探究的蛋白质相互作用的数据库，之前介绍过STRING就是这样的数据库，为什么很多生信的文章都是使用STRING来探讨基因之间的相互作用关系，主要原因还是STRING支持输入多个基因，寻找多个基因之间的相关作用关系。但是如果我们只有一个基因的话，想要知道这个基因和其他什么基因有关系的话，这个时候，STRING虽然也能做，但是预测的结果和结果的多样性就没有另外一个数据库好了。这个数据库就是 BioGRID (https://thebiogrid.org/ , 点击阅读原文可直达数据库)。
医学数据库百科
2020-06-01
786
0
STRING：蛋白相互作用数据库的使用
生物基因
昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识（相互作用网络分析基础）。对于基因组数据分析而言的话，我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。
医学数据库百科
2020-06-01
1.2K
0
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