VarPaper知识共享计划启动了

子曰:有朋自远方来,不亦乐乎?

八方来客,犹如八仙过海,用上VarPaper的八大神功,破解人间疾苦与烦恼,岂不快哉?

VarPaper本着开放、共享、赋能的宗旨,今天启动了知识共享计划,愿与业界机构、公司、专家一起携手,共同推动中国的基因研究与临床转化!

一、VarPaper平台介绍

VarPaper是一款智能基因组医学精准搜索平台,类似谷歌学术,不过更专业、更智能、更强大!目前整合了PubMed的2800万篇文献和近300个基因组医学和生物信息学数据库,利用人工智能算法,实现了变异、基因、表型、药物4大模块的智能检索和组合智能检索,为科研和临床提供简单高效的精准检索和知识探索服务。

二、VarPaper使用

VarPaper可以免费在线注册使用,网址:http://varpaper.com:8080/webes/login

登录后可以看到检索主页,界面清新简洁,提供了搜索例子,帮助用户快速上手:

三、VarPaper八大神功

1、模块过滤,无比神奇

以胰腺癌产品开发为例,在表型方框内输入pancreatic cancer,点击搜索按钮,出来文献后,选择model选项的变异var,即可找出全部变异文献,通过批量下载功能,把文献全部下载下来,开发产品是不是很省时省力。想起我在明码生物开发GWAS产品时,一个疾病多种描述+GWAS+多个基因,自由组合起来达到十几个,每个都要检索,返回文献后,每篇文章再查下影响因子,小于5的不看,下载不了的,还要麻烦高校学生帮着下载,真是耗时耗力,还要一大笔花费开销给到高校学生!

2、基因结合表型,精准定位疾病

我们以三晋遗传的一个病例来说明这个功能的重要性:这个病例是孕妇胎儿的无创检测,发现Xp22.31区域存在1.05Mb缺失,涉及HDHD1, MIR4767, STS等三个基因,临床诊断发现胎儿偏小4周,不知道是什么疾病,此时,数据库与文献调研就非常重要了。

检索方法:在基因方框输入三个基因:HDHD1;MIR4767;STS(注意以分号隔开),表型方框输入Xp22.31,点击搜索按钮,结果如下:

由上图可知,找到27篇文献,并且高亮了疾病和基因,至于是哪个疾病,可以点击全文查看,慢慢研究。

3、一次检索,全部返回

以rs113488022为例,文献中该变异的所有描述都会找到并且高亮

由上图可知,在变异方框内输入rs113488022,该变异的其他描述的文献也都找到了,并且都高亮,如V600E, 1799T>A等。

4、变异不敏感,九九都归一

以顾大夫之前一个的例子来说明,详情见下图:

对于基因PLA2G6的两个变异c.238G>A和c.1472A>G(又名c.1634A>G),两家基因检测机构的结果完全不同,该怎么办呢?

有VarPaper,不用怕。我们分别检索看看结果:

第一个变异c.238G>A:

咱们用VarPaper查询第一个变异c.238G>A,结果如下:

不错,有4篇文章,可以好好研读了。

第二个变异,检索结果如下

由上图可知,两个检索,结果完全一样,而且文献质量很高,是不是很智能?!

5、老药新用,激发灵感

如检索药物,过滤疾病模块,通过非关联分析理论,可能会发现新的适应症,二甲双胍就是典型,起初用于治疗糖尿病,后来发现还能预防心血管病和癌症。更多案例需要您来探索了。

6、300数据库,一键全打通

7、文献好不好,影响因子看一看

8、文献全文,在线查看与下载

90%的文献,支持全文在线查看与下载

四、VarPaper用户

VarPaper当前主要提供文献搜索功能,是基因与生物医药领域的一项最基本的需求,用户群体广泛、应用场景很多,做研究、做学术、做临床的都离不开它。

欢迎医院、高校与科研院所、基因与生物医疗公司、制药企业洽谈合作。

公司介绍:

循证智能科技(上海)有限公司是一家把人工智能应用在精准医学的高科技公司,通过构建生物医疗领域的超级搜索平台,即变异、基因、表型、药物的智能搜索引擎VarPaper和关联数据库,为科研和临床提供高效的精准检索和知识探索服务。

公司价值观:

用心关怀每一位员工

细心服务每一名用户

真心合作每一个伙伴

VarPaper愿景:

重新定义文献检索:专业知识 + 人工智能 = 所想即所得

VarPaper优点:

精准、全面、文献质量高、简单易用

VarPaper使命:

通过智能化PubMed文献,构建生物医疗领域的超级搜索平台,即变异、基因、表型、药物的智能搜索引擎VarPaper和关联数据库,为科研和临床提供高效的精准检索和知识探索服务。VarPaper被誉为科研与学术的天堂,关联分析与知识探索的优秀平台,服务于科研最开始一公里的选项目定课题和临床最后一公里的决策支持。

联系方式:

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20181012G160DJ00?refer=cp_1026
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