核酸研究又放出一大波数据库工具啦!

18年到了,核酸研究(Nucleic Acids Res)又更新一大波数据库,今天就给大家扒一扒有哪些好用的吧~

TCMID 2.0 (http://www.megabionet.org/tcmid/)

研究中药的童鞋切莫错过!

这检索界面不得不给他点个赞,只要用拼音就可以了!

TCMID的查询包含了药方、中草药、原料、疾病、西药以及靶点

举个简单的例子,我们先去Target里搜一搜靶点

然后我们可以看到和哪些中药成分有关

根据中药成分我们就可以找到相应的中药。

我们甚至还能建立调控网络

药物成分与靶基因的调控网络

药物成分——靶点——疾病——药物的调控网络

这是一个有关疾病基因调控网络的数据库

可以直接输入疾病名称构建一个调控网络,比如搜个帕金森

整个调控网络就粗来了!

不搜疾病,搜多基因同样可以得到一个调控网络

调控类型太复杂,我们也可以筛选Type,只选上调,下调或者转录等关系。

eRAM (http://www.unimd.org/eram/)

稀有疾病注释数据库

可以检索到稀有疾病的疾病基本信息

以及检索疾病相关的基因

我们还可以检索疾病与疾病在表型、基因等的交叉区域。比如下图就检索了与cowden syndrome和gastrointesinal stromal tumor两个疾病都有关联的基因。

这的功能对于研究像糖尿病引发心肌病、动脉粥样硬化共抑郁这样的疾病的童鞋还是很有用的!

好了,今天的数据库就介绍到这里,核酸研究里还有很多新的数据,之后再慢慢介绍给大家!

PS:OT已经被干掉了,但是不要方,我们还有这么多好用的数据库,发文章都是小事儿!

关注后获取《科研修炼手册》1、2、3、4、5。

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  • 原文链接:http://kuaibao.qq.com/s/20180116G0PVUS00?refer=cp_1026

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