【优质期刊】文献【泛读，精读】笔记。关注癌症，生信，多组学，数据库，科研工具，精准医学，临床研究，生物技术，计算机技能，大语言模型的应用。

可以看到， 仅仅是7个病人，但是文章写到：We constructed a single-cell atlas for 184,426 high-quality...

      前面我们使用10x visium HD结直肠癌样本数据介绍了基于H&E图像进行细胞分割，得到了单细胞精度的空间数据，然后和单细胞分析一样，进行降维聚...

该部分展示了结肠炎相关细胞簇（5-8cluster）与非结肠炎相关细胞簇（1-4cluster）之间显著差异表达基因的排名。研究者对这些基因进行了筛选，标注了前...

这个数据对应的文献于2022年11月15号发表在Cell Discov. 杂志上，标题为《Single-cell sequencing unveils key ...

主要标志（驱动衰老）：基因组不稳定性、端粒磨损、表观遗传改变、蛋白质稳态丧失、自噬失能。

高亲和力的肽-人类白细胞抗原（HLA）分子结合是启动适应性免疫应答的关键。因此，精确预测肽-HLA（pHLA）结合能力对疫苗设计、肿瘤免疫治疗及自身免疫疾病机理...

然后，我搜了一篇文章，忘记怎么搜到的了，标题为《Single-cell dissection of cellular and molecular feature...

看到了一个超详细的对T细胞亚群进行分析的文献，分享给大家！参考文献标题：《Integrated single-cell transcriptome and T ...

◉ 图1. 样本和实验策略的概述 (A) 预测对血浆蛋白质组有很大影响的器官和细胞从每个器官和细胞类型至少三个个体中收集或分离。◉ (B) MS实验设计的示意图...

今天分享的这篇文章发表于2024年8月《Cell》期刊，内容聚焦脑-心跨器官研究新思路。这也是脑心轴研究领域开创性的文章。中风造成的急性脑损伤会触发无菌性、系统...

这里展示了 "CD4T cell", "B cell" 这两种细胞间的具体通讯结果，通讯的连线不同的颜色代表不同的互作情况。

所以我就要了一下这个数据集和文章，是中山大学附属第六医院 ：《Remodeling of the immune and stromal cell compart...

Single-cell experiments: 10x Genomics 5’ v2 RNA-sequencing, B cell receptor sequ...

◉ 图1。衰老的14个特征的示意图概述及其在初级、拮抗和整合层面上在衰老过程中的作用。注意，与2023年在《细胞》杂志上发表的关于12个衰老特征的旧描述相比，这...

2025年4月3日华大生命科学研究院等团队联合攻关， 发表在Cell主刊题为：Single-cell spatial transcriptome atlas a...

Xenium或者VisiumHD等空间组学数据可以进行很多不同于单细胞的空间分析，比如本文提到的最近邻分析，它可以根据坐标判断一个细胞类型周围的最近邻细胞的分布...

◉ 图1。CPTAC数据集概述和精确肽组学工作流程（A）CPTAC队列包含来自10种不同癌症类型的1,064名具有不同遗传祖先的个体以及可用的数据类型。顶部分布...

GSEA多条通路结果展示图我们前面分享过一个漂亮的气泡图：Science杂志高颜值GSEA打分排序图

今天的这个数据也是一篇非常经典的单细胞与空间转录组数据联合分析的经典文献，于2020年7月份发表在 CELL上，标题为《Multimodal Analysis ...