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#lme4

数据分享|R语言用lme4多层次(混合效应)广义线性模型(GLM),逻辑回归分析教育留级调查数据|附代码数据

拓端

为了指定一个多层次模型,我们使用lme4软件包。随机斜率项和聚类项应该用|分隔。注意,我们使用了一个额外的参数指定比默认值(10000)更大的最大迭代次数。因为...

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R语言主成分PCA、因子分析、聚类对地区经济研究分析重庆市经济指标|附代码数据

拓端

建立重庆市经济指标发展体系,以重庆市一小时经济圈作为样本,运用因子分析方法进行实证分析,在借鉴了相关评价理论和评价方法的基础上,本文提取出经济规模、人均发展水平...

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R语言线性混合效应模型(固定效应&随机效应)和交互可视化3案例|附代码数据

拓端

线性混合效应模型是在有随机效应时使用的,随机效应发生在对随机抽样的单位进行多次测量时。来自同一自然组的测量结果本身并不是独立的随机样本。因此,这些单位或群体被假...

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R语言线性混合效应模型(固定效应&随机效应)和交互可视化3案例|附代码数据

拓端

线性混合效应模型是在有随机效应时使用的,随机效应发生在对随机抽样的单位进行多次测量时。来自同一自然组的测量结果本身并不是独立的随机样本。因此,这些单位或群体被假...

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BLUP is a good thing!

邓飞

关于线性混合模型(Linear Mixed Model)的简称是LMM,全称是林妹妹的源头是:统计之都发布的杨灿的文章《昔日因,今日意》:

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育种数据分析神器:线性混合模型

邓飞

这里使用sleepstudy数据集,看一下免费的R包lme4和付费包asreml如何处理不同的混合线性模型,以加深对混合线性模型的理解。

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全同胞家系如何计算遗传力及育种值

邓飞

大家好,我是飞哥,今天是农历七月初七,中国的情人节,祝大家节日快乐,有情人终成眷属,单身的尽快脱单。

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GWAS计算BLUE值2--LMM计算BLUE值

邓飞

本节,介绍如何使用R语言的lme4包拟合混合线性模型,计算最佳线性无偏估计(blue)

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R语言用Rshiny探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM)

拓端

随着软件包的进步,使用广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM)变得越来越容易。由于我们发现自己在工作中越来越多地使用这些模型,我们开发了一套R sh...

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混合线性模型如何检测固定因子和随机因子的显著性以及计算R2

邓飞

很多朋友写信问我, 像要知道固定因子的显著性和随机因子的显著性如何计算,他们使用的是lme4这个R包, 但是这个包使用anova时没有P值,还要手动计算, 随机...

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我为什么不用ANOVA?

邓飞

ANOVA(Analysis of variance)是Fisher在1918年发明的一种方差分析方法。因为我们多数人在数理统计入门时重点学习过,所以最常使用。...

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