王诗翔呀

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  • CentOS/Redhat R包使用新的gcc编译

    一些有C++代码的R包可能会用到一些新的C++特性,需要C++11或者C++14。这个问题通常在CentOS/红帽系统上出现,因为系统稳定的要求,这个系列的系统...

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  • 「R」使用modules包来组织R的函数集合

    接触过Python的朋友肯定对模块很熟悉,R的代码组织方式以包为主。但基于文件的模块形式也是可以实现的,modules[1] 包提供了这种支持。

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  • 你了解如何使用Bash的数组吗?

    之前使用Shell编程很少使用到数组,最近尝试使用后发现它在某些情况下非常有用。这里简单介绍如何生成和使用数组。

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  • 保姆级 IGV 基因组浏览器使用指南(图文详解)

    这次我们一起科研论文中常用到的桌面级基因组浏览器 IGV,优势在于可以离线使用,方便大家直接查看本地文件,而且渲染速度相较在线基因组浏览器网站要快不少。

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  • R沟通|Bookdown中文书稿写作手册(上)

    今年接了 5 本与贝叶斯近似计算包INLA相关的翻译书,将由高等教育出版社出版。在准备翻译的时候,我静下来思考了一下二个问题。一是互联网时代在兼顾图书质量的同时...

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  • UCSCXenaShiny 正式见刊发表!

    UCSCXenaShiny 是我 19 年通过 Openbiox 发起的项目(地址:https://github.com/openbiox/UCSCXenaSh...

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  • 「R」针对重复ID的处理

    重复,特别是针对一些样本名称的重复问题的处理,是我在进行生信分析时经常遇到的。一种常见的解决策略是先找到重复之处,然后去重。但如果我们想要保留全部的重复ID呢?

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  • 使用docker镜像测试UCSCXenaShiny在Linux下的安装

    ERROR: dependencies ‘gmp’, ‘Rmpfr’ are not available for package ‘PMCMRplus’

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  • 如何通过不同的命令启动一个已经关闭的docker容器

    做这个的目的是对镜像容器进行测试,在运行过的容器中,我新增了一些文件,而我想检查它们的所属群组关系,以便于正确地编写脚本进行自动化。

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  • 「LeetCode」0001-两数之和

    代码仓库:https://github.com/ShixiangWang/LeetCode[3]

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  • Make

    原文:https://seankross.com/the-unix-workbench/working-with-unix.html#make

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  • 「R」R4.1新特性:管道符号|>与匿名函数构造\(x)

    目前不同平台的安装包已经可以通过CRAN下载了,国内推荐清华大学镜像:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

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  • 「R」grid图形坐标系统

    绘图时,我们需要坐标才能准确地对要绘制的对象进行定位。在 grid 包中,有多种绘图坐标系统,选择一个合适的加以利用可以帮助我们更好地绘制图形。

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  • 「R」grid 图形对象 grobs

    学习材料:https://bookdown.org/rdpeng/RProgDA/the-grid-package.html#grobs

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  • 好用的免费科研绘图神器,推荐试试

    想必很多科研和临床的同道,都会感叹科研的苦和累。既要处理众多的临床病人、收集样本,又要忙实验、分析数据,同时还要紧跟科研前沿文献和撰写文章。涉及到文章的门面,科...

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  • 快速上手使用Singularity进行生物信息分析

    生信分析流程往往需要消耗数以万计的电脑计算资源。另外,生信分析过程中会用到大量的分析程序以及脚本,还需要对运行环境进行配置与管理。这会导致分析的可重复性变低,导...

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  • 「Workshop」第三十九期 主成分分析

    通过正交变换将一组可能存在相关性的变量转换为一组线性不相关的变量,转换后的这组变量被称为主成分。换句话来说是,当变量较多时,有些变量所反应的信息是重复的,主成分...

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  • 「Workshop」第四十期 常用的差异分析方法

    如今在生物学研究中,差异分析越来越普遍,也有许多做差异分析的方法可供选择。但是在实际应用中,大多数人不知道该使用哪种方法来处理自己的数据,所以今天我就来介绍下目...

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  • 「Workshop」第四十一期 t-SNE降维原理及其应用

    降维:就是指采用某种映射方法,将原高维空间中的数据点映射到低维度的空间中。降维的本质是学习一个映射函数 f : x→y,其中x是原始数据点的表达,目前最多使用向...

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  • 「Workshop」第四十二期 R文件读写

    rio是一个比较简单,但是又非常强大的一个数据读写包,这个包的特点是:根据文件的拓展名推断文件的类型,然后调用不同的包来读写数据,目前支持的文件类型

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