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首页标签bioinformatics

#bioinformatics

使用 nbia-data-retriever 在 linux 下载数据

叶子Tenney

美国癌症医学影像档案中心 (The Cancer Imaging Archive, TCIA) 可以下载癌症病例数据,对于 mac 和 win 来说下载软件使用...

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Node 转录组数据库批量下载指南

叶子Tenney

随着转录组研究的深入,研究人员需要从转录组数据库中获取大量的 RNA 测序数据以支持基因表达、选择性剪接等分析。除了我们常用的 GEO(基因表达总库)和 Arr...

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Bioinformatics|南昌大学施绍萍等人提出PocketDTA,通过靶点结合口袋的3D结构增强药物-靶标亲和力预测

智药邦

2024年10月4日,南昌大学施绍萍等人在Bioinformatics上发表论文PocketDTA: an advanced multimodal archit...

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TCGA 联合 GTEX 分析流程

叶子Tenney

在我们使用 TCGA 数据进行差异分析的时候,可能会遇到肿瘤和正常数据之间的不平衡的问题。为了得到更科学的结果,结合 GTEx 项目提供的正常样本数据是一种较为...

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FeaturePlot_scCustom作图

JJJJack

Seurat object里面有12个samples, 我想呈现A gene在12个samples里面的表达情况。FeaturePlot()是首选,然后12个s...

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Bioinformatics|Hi-GeoMVP:用于药物反应预测的分层几何增强深度学习模型

智药邦

2024年4月13日,新加坡国立大学Yurui Chen等人在Bioinformatics上发表文章Hi-GeoMVP: a hierarchical geom...

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受试者工作特性曲线 (ROC) 的原理及绘制方式

叶子Tenney

受试者工作特性曲线 (Receiver Operating Characteristic, ROC) 曲线是生信分析中一种常用的性能评估方法,那么他背后的原理是...

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Bioinformatics|MoleMCL:分子预训练的多层次对比学习框架

智药邦

2024年3月26日,厦门大学刘向荣教授团队在Bioinformatics上发表文章MoleMCL: a multi-level contrastive lea...

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Bioinformatics|MARS:基于模体的自回归模型用于逆合成预测

智药邦

2024年2月29日,深圳大学欧阳乐老师、腾讯人工智能实验室赵沛霖研究员团队在Bioinformatics上发表文章MARS: a motif-based au...

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Bioinformatics|MolFeSCue:基于小样本对比学习增强有限和不平衡数据下的分子性质预测

智药邦

2024年2月29日,吉林大学周丰丰教授团队在Bioinformatics上发表文章MolFeSCue: enhancing molecular propert...

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fqkit: 一个处理fastq序列的小工具

生信小驿站

一个用于处理fastq测序文件的命令行小工具,功能还在不断更新中,子命令也不多,支持gzip压缩文件的输入和输出(结果文件名以.gz结尾,结果会自动压缩)。

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生信星球161期Day1_lily

用户8149829

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德睿论文Bioinformatics | 生物数据挖掘领域的AI大语言模型Benchmark研究

DrugOne

近日,「德睿智药」与广州生物岛科学家团队的合作论文“An Extensive Benchmark Study on Biomedical Text Genera...

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R-note

肥颖

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for autho...

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day3

无端

数据类型:向量(vector);数据框(Data Frame);矩阵(Matrix);数组(Array);List。

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DAY2

无端

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生物信息学权威期刊Bioinformatics发文量最大的是谁

生信技能树

然后又看到了目前位于德国的顾祖光公众号发布的蛮有意思的探索,使用了pubmedR这个包,统计具体的某个杂志的文章的作者发文量情况:

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