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LV1
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绘制中国个省份地图

p<-choose.files() #导入bou4_4m/BOUNT_poly.shp文件

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rgdal包readOGR使用

SP将地理数据分割为两大块:描述层和映射层,可以使用rgdal包的readOGR()函数读取数据。

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不同的坐标轴转换绘制世界地图

color1<-brewer.pal(9,"YlOrRd")[c(3,4,5,6,7,8,9)]

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ggplot绘制地图

china_map<-readShapePoly("D:/Beautiful-Visualization-with-R-master/map/bou2_4p.s...

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绘制热图

colormap <- colorRampPalette(rev(brewer.pal(n = 7, name = "RdYlBu")))(100)

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分面图facet_wrap和facet_grid

facet_wrap()和facet_grid()两个函数可以根据分类数据绘制一系列的子图,包括矩阵分面图、行分面图、列分面图。

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tSNE可视化

t-SNE是一种用于探索高维数据的非线性降维算法,非常适合将高维数据降到二维或者三维,在使用散点图等基本图表进行可视化。PCA是一种线性算法,他不能解释特征之间...

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高维数据的展示

降维方法分线性降维和非线性降维两大类,其中线性降维包括主成分分析PCA,多为尺度分析MDS,非矩阵分解NMF等;非线性方法包括等距特征映射和局部线性嵌套,tSN...

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小提琴图绘制

treatment = rep(c("elevated","ambient"),150))

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一粒沙

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绘制带显著性比较的bar图

geom_boxplot(position=position_dodge(),width=0.5)+

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绘制带误差bar的统计图

df<-ToothGrowth #这里用的是R自带数据Toothgrowth

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多系列数据核密度图

ggridges包提供了geom_density_ridges_gradient()函数,用于画核密度估计峰峦图

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数据分布图之统计直方图和和核密度估计图

该函数两个主要参数bw(箱型的宽度)和kernel(核函数),核函数默认为高斯函数gaussian其他函数包括:epanechnikov,rectangular...

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R语言绘制曲线图

geom_smooth/stat_smooth一条平滑的线,但他是拟合曲线,不会遍历所有数据点

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QQ图和PP图

对于一组数据是否符合某个分布,有很多种统计检验的方法,比如K-S检验,卡方检验,从图形上我们可以用Q-Q图和P-P图来检查数据是否服从某种分布。他们可以检验的分...

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绘制带回归线的散点图

按自变量的多少分为一元和多元回归分析;按自变量和因变量的关系分为线性和非线性回归;比较常用的是多项式回归、线性回归和指数回归。

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表达差异基因分析

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样本相关性分析

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绘制极坐标系条形图

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