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R版BBKNN整合去批次
编程算法
github
git
开源
r 语言
之前我有测试过很多整合去批次的算法，例如CCA，RPCA，harmony，LIGER等：
生信技能树
2023-02-27
1.2K
0
R不规则数据长变宽
python
编程算法
r 语言
我看了看，大概是提问的小伙伴自己没搞清楚自己想要什么，他自己给出来了一个非常丑陋的解决方案， 他实现如下：
生信技能树
2023-02-27
580
0
安装退出历史舞台的R包
https
网络安全
linux
r 语言
数据处理
会根据包的情况自动跳转，这个包就进入了：https://cran.r-project.org/web/packages/customLayout/index.html
生信技能树
2022-07-26
650
0
RNA-seq入门实战（九）：PPI蛋白互作网络构建（上）——STRING数据库的使用
数据库
sql
r 语言
go
编程算法
连续两次求贤令：曾经我给你带来了十万用户，但现在祝你倒闭，以及 生信技能树知识整理实习生招募，让我走大运结识了几位优秀小伙伴！大家开始根据我的ngs组学视频进行一系列公共数据集分析实战，其中几个小伙伴让我非常惊喜，不需要怎么沟通和指导，就默默的完成了一个实战！
生信技能树
2022-07-26
5.4K
0
通过R包UCSCXenaTools链接UCSC的XENA浏览器来探索TCGA等公共数据
https
网络安全
r 语言
类似的机构其实还是 MD Anderson Cancer Center 和 UCSC，其中UCSC的XENA浏览器就把TCGA等公共数据整理的工工整整。官网链接是：https://xenabrowser.net/
生信技能树
2022-07-26
701
0
复制粘贴就能运行的100套R实战演练代码也有错误
r 语言
硬件开发
前面整理了100多套R代码，因为时间跨度有点长，而且公众号写作后没办法修改，所以安排实习生进行代码审查，看看是不是确实复制粘贴就可以运行。
生信技能树
2022-06-27
849
0
往前一步是优秀，退后一步是懵懂
数据挖掘
r 语言
我们的生信入门班和数据挖掘线上直播课程已经有了三年多的历史，培养了一波又一波优秀的生信人才。前面提到R语言授课时的超纲练习题，已经分享过两位优秀学员的答案。
生信技能树
2022-06-27
633
0
超纲练习题不超纲
数据挖掘
r 语言
云直播
我们的生信入门班和数据挖掘线上直播课程已经有了三年多的历史，培养了一波又一波优秀的生信人才。本期分享的内容不是课堂上讲的，而是给了踮一踮脚能做出来的超纲练习题，启发学员主动学习，而不是一味等待投喂。
生信技能树
2022-06-27
577
0
一波三折终于在R里面读入了这个Excel表格
文件存储
r 语言
换成read.table() 后 （我也不知道自己为什么会这样思考，换函数肯定是不对的，但是初学者就是需要勇于探索，在碰壁中成长）
生信技能树
2022-06-08
560
0
学习order函数的记录
r 语言
linux
看到这个问题的时候，我是不知所云的，因为课堂上只讲过order(x)，没有出现order(x,y)，不理解其运算逻辑，就不能理解函数的结果。因此我整合了order( )函数从基础到上述问题解决的学习过程，仅供参考！
生信技能树
2022-06-08
997
0
学习R语言里的排序函数
r 语言
其他
我们的生信入门班和数据挖掘线上直播课程已经有了三年多的历史，培养了一波又一波优秀的生信人才。新一期的生信入门班学员热情高涨，他们富有探索精神，又乐于助人，这是一个在帮助别人的过程中自己也获得进步的例子，令我们非常开心。
生信技能树
2022-06-08
1K
0
从 R 绘图入门看 R 语言学习方法论
https
网络安全
数据分析
r 语言
因为一些网络素材引用不规范，我们的这个笔记被网络吞掉了一次。很多朋友在公众号后台催更，还好鲍志炜抽空抢救回来了，不负大家的等待。
生信技能树
2022-06-08
876
0
记录单细胞学习过程中的两个R包报错
github
git
开源
r 语言
1.SeuratData包，因为学习单细胞测序的很多示例数据全在这个包里，所以这个包的出镜频率其实是比较高的，但是我在成功下载后library出现了如下报错
生信技能树
2022-06-08
2.8K
0
Mac电脑安装自己的conda
linux
python
r 语言
数据分析
打开conda官方网站，查看版本和下载链接：https://repo.anaconda.com/miniconda/
生信技能树
2022-03-03
1.5K
0
套娃一样的conda和r
r 语言
https
网络安全
数据分析
一般来说， 假如大家有一些R包安装非常困难，或者某个数据分析的流程基于了一系列R包，我们会使用conda来安装R语言及其配套的R包，比如：singlecelltk和singlecellsignalr，很简单的几句话代码，主要是安装适合自己用户的R语言环境及相关的R包：
生信技能树
2022-01-10
1K
0
你不需要真的这个包，而仅仅是需要它里面的数据
http
r 语言
数据库一体机 TData
实际上，但凡学过一点点R语言的，都知道如何下载这样的R语言源代码压缩包文件来进行安装。实际上，这个包的 的官方说明书也写的很清楚：http://research-pub.gene.com/IMvigor210CoreBiologies/
生信技能树
2021-12-24
1.3K
0
使用conda配置一个单细胞数据分析环境
https
r 语言
网络安全
anaconda
html
这个时候，你无需理会你的服务器的R语言版本或者R包啦，因为你每次都会 conda activate r 激活你自己的R语言环境哦。我们在这个环境里面安装了 bioconductor的 singlecelltk和singlecellsignalr，因为它们本身就会依赖大量的其它R语言包，所以理论上这个时候你的这个 conda activate r 小环境，已经是比较好的可以用来做单细胞转录组数据分析的啦！
生信技能树
2021-11-25
2.1K
1
R包安装失败居然真的是版本问题
html
http
https
网络安全
r 语言
我下意识的认为他应该是有其它错误，但是看大家在群里讨论的热火朝天， 我就去试了试。首先看了看最原始的安装方式：
生信技能树
2021-10-12
3.6K
0
使用R语言的parallel包调用多个线程加快数据处理进度
http
html
tcp/ip
r 语言
https
使用方法非常简单， 就是 makeCluster 函数定义好需要并行计算的线程数量，然后之前的apply家族循环就区别在函数名字前面加上par的签字，比如 lapply就替换成为了 parLapply 函数。
生信技能树
2021-10-12
4K
0
在非Linux系统的电脑也可以使用命令行工具操作R语言
r 语言
命令行工具
git
windows
而在个人电脑，通常是Mac或者Windows，都是直接使用界面版本的rstudio更方便的交互式使用R语言。交互式的好处是所见即所得，每个代码随时响应随时看到效果，尤其适合各种各样的统计可视化需求。
生信技能树
2021-10-12
1.2K
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