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育种数据分析之放飞自我

生物统计, 数量遗传学, GWAS, GS
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还不会基因型数据填充?来看这一篇!
大家好,我是邓飞,今天介绍一下基因型数据的填充,包括自填充和填充到参考集上的方法。
邓飞
2022-12-13
1.7K0
使用bedtools进行gwas基因注释
今天我把之前的GWAS教程更新了一般,工作量太大了,还没有搞完。我用Typora重新编辑了一下,界面美观多了,又增加了一些内容,明天下午做好之后会发个公众号,让大家领取,敬请期待呀!
邓飞
2022-12-13
1.1K0
LDblock绘制连锁不平衡和单体型图
在GWAS分析中,我们挖掘到了一些显著性的位点,如何确定这些位点是不是假阳性呢?我们可以通过LDblock分析并进行可视化进行判断。
邓飞
2022-12-13
1.5K0
多基因风险预测模型2--相关概念和软件
官网:https://jmarchini.org/software/#impute-5
邓飞
2022-12-13
4570
旧版本的R3.6安装最新版的ggplot2
本来我这个段位,就不应该为安装包发愁了,毕竟统计学不会可以理解,编程学不好忍忍就过去了,但是说安装包出错,是可忍孰不可忍?
邓飞
2022-12-13
1.3K0
干货:把知识经验整理为电子书
大家好,我是飞哥,参加工作七年了,写了很多博客,但是,博客,公众号,有很多不完美的地方,错别字,描述错误,方法错误。
邓飞
2022-12-12
5050
当R语言遇到plink,就在R中运行plink吧
R语言和plink软件都是常用的软件,随着对软件的熟悉,就不用自己写代码了,直接改代码了,既然改代码,就在一个环境下运行就行了,不想来回切换R和Bash。问题来了:如何在R语言中运行plink软件。
邓飞
2022-12-12
2K0
R语言学习看最新版的电子书不香嘛?
我买了很多R语言的书籍,很多时候我是想通过买书来鞭策自己多多学习,毕竟,实体的书籍花的是真金白银,沉默成本在哪里,不看就太可惜了。
邓飞
2022-05-19
6490
windows系统VScode配置R语言
一直在Rstudio中编写R语言程序,这里,想用VScode进行R语言的编写,毕竟除了R语言,还要编写Python,Shell,Julia等语言,Vscode是通用的平台。
邓飞
2022-05-19
1.5K0
推荐一款适合中文博客书写的Typora主题
Typora自带的主题太难看了,不适合中文的书写,今天推荐一款主题,专门为中文书写而设计,界面非常好看,值得推荐,看一下效果:
邓飞
2022-04-06
6K0
学习R语言这几本电子书就够了!
这里推荐几本线上的电子书,作者都在不断的更新,网页版的电子书,copy代码无障碍,无广告,很流畅。
邓飞
2022-02-09
1.2K0
GCTA学习3 | GCTA的两篇NG:fast-LMM和fast-GLMM
GCTA在2010年首次释放,现在的版本是1.94.0beta,2021年到现在更新了3次,重要的更新时增加了fastGWA、fastGWA-GLMM,相关文章发表在NG上。
邓飞
2022-02-09
6720
GCTA学习2 | 软件下载安装--windows和Linux
GCTA官网:https://yanglab.westlake.edu.cn/software/gcta/#Download
邓飞
2022-02-08
4.5K0
GCTA学习1 | 抛砖引玉--初步介绍
康德说:世界上只有两样东西是值得我们深深景仰的,一个是我们头上的灿烂星空,另一个是我们内心的崇高道德法则。
邓飞
2022-02-08
1.2K0
GWAS分析新软件 | GMATs:解析复杂性状和复杂遗传机制的高效工具
飞哥介绍:终于向作者要来了PPT,在动物大会上听了这个做GWAS的软件,一直想学习,今天作者回复了PPT内容,先分享一下。个人认为这款软件的特色:
邓飞
2021-11-26
1.1K0
用最酷的方法学习R语言
这里推荐几本线上的电子书,作者都在不断的更新,网页版的电子书,copy代码无障碍,无广告,很流畅。
邓飞
2021-08-05
7560
1.5w字的Rmarkdown入门教程汇总
Rmarkdown 是 R 语言环境中提供的 markdown 编辑工具,运用 rmarkdown 撰写文章,既可以像一般的 markdown 编辑器一样编辑文本,也可以在 rmarkdown 中插入代码块,并将代码运行结果输出在 markdown 里。R Markdown 格式,简称为 Rmd 格式, 相应的源文件扩展名为.Rmd。输出格式可以是 HTML、docx、pdf、beamer 等。
邓飞
2021-04-22
8.9K0
RStudio server 自动掉线 安全是安全了,但是方便在哪里???
勾选Stat signed in when browser closes,再次打开RStudio还是要重新登录!
邓飞
2021-03-30
2.6K1
良心教程 | 如何在Typora中设置免费的图床
https://github.com/Molunerfinn/PicGo/releases
邓飞
2020-12-29
5.9K0
混合线性模型学习笔记1
利用混合线性模型在农业,食品科学,生物学,医学和技术科学中的应用,获得有关数据统计分析的知识和能力。
邓飞
2020-05-20
5450
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