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生信了

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43

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PaperR-(4)-2022-10

https 网络安全

Nature Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids

2022-11-30

3910

PaperR-(3)-2022-09

https 网络安全数据结构深度学习 python

Automated reconstruction of whole-embryo cell lineages by learning from sparse annotations

2022-11-30

3490

单细胞组学简介

https http 网络安全 html

我们知道生命过程是建立在细胞时空动态调控的基础上的。比如，胚胎发育过程中，随着时间推进，细胞不断分裂、分化、成熟；其过程同时也受到空间信息的调控，比如周边细胞的细胞间通讯。

2022-11-30

8270

R记录 - 最近在学习写一个R包

https 网络安全 html 编程算法

因为课题需要，最近需要实现一个数据可视化的功能。因为ggplot2提供了扩展接口，所以就想着基于ggplot2实现这个功能。看了一些文档之后（见文末），就开始动手实现了。

2022-08-30

2110

R语言作图入门——软件安装，数据导入

r 语言 https 网络安全腾讯云开发者社区

小仙最近受到了一个打击，之前小仙以为自己写的教程已经比较适合入门了，初学的选手就跟着就能画出图。但是小仙却忽略了一点，粉丝们可能来自不同的行业，拥有不同的专业背景。有些同学可能在特定的情况下接触到了R语言，在下定决心要自己试试的时候，却不知如何入手。

2022-04-19

6080

bash https bash 指令网络安全 linux

Portable Batch System (or simply PBS) is the name of computer software that performs job scheduling. Its primary task is to allocate computational tasks, i.e., batch jobs, among the available computing resources. It is often used in conjunction with UNIX cluster environments. (fromPBS Wiki page [1])

2020-11-05

1.3K0

cython初体验

python 打包 c++https

笔者最近参与了一个项目，其目的是提升一个python程序的运行速度。其中一个手段就是利用cython来优化原来的python代码。笔者之前没有接触过cython，所以这次属于在实践中学习新知识。

2020-06-16

1.1K0

生信（11）htslib处理bam或sam文件的简单示例

api 打包 ide https linux

（本文写于2020年初，随着将来htslib和samtools库的更新，本文部分内容可能会不适用，请读者注意官网的更新动态。）

2020-03-25

1.9K0

R语言模拟疫情传播-RVirusBroadcast

java https r 语言网络安全

前几天微博的一个热搜主题是“计算机仿真程序告诉你为什么现在还没到出门的时候！！！”，该视频用模拟的疫情数据告诉大家“不要随便出门（宅在家）”对战胜疫情很重要，生动形象，广受好评。

2020-02-26

8050

R语言模拟疫情传播-gganimate包

https 网络安全 github git 开源

前文《R语言模拟疫情传播-RVirusBroadcast》已经介绍了一种用R语言模拟疫情传播的方法，不过当时为了实时模拟数据（没有事先准备好的数据集可用）的动态展示效果，笔者在RVirusBroadcast中使用的是R中的基础作图功能，在本文中我们将用gganimate包来生成动态图。

2020-02-26

1.3K0

Python+selenium自动下载xml或exe文件

xml https 网络安全 python

笔者最近在写一个小工具，需要从pubmed上批量下载包含文献信息的xml文件。很明显，这是一个爬虫任务，笔者选用了python+selenium的组合。代码写好后运行一切都很顺利，直到最后Chrome出现了警告信息，提示我是否要保留文件：

2019-12-05

1.8K0

生信（三）（转载）HLA-typing软件

https http 网络安全

表格来源：https://www.nature.com/articles/jhg2015102/tables/2

2019-07-27

7950

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