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采用igraph包分析网络数据
编程算法
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对于网络的可视化和数据挖掘，有很多图形界面的软件可供选择，比如cytoscape, gephi 等等，这些软件使用方便，操作简单，功能的强大，但是同时也有着一个缺点，就是无法自动处理，只能通过人工点击鼠标来操作，对于大批量数据的分析而言，依靠人工费事费力。
生信修炼手册
2020-05-08
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如何从PPI网络进一步挖掘信息
数据结构
unity
编程算法
从数据库中得到蛋白质的相互作用信息之后，我们可以构建蛋白质间的相互作用网络，但是这个网络是非常复杂的，节点和连线的个数很多，如果从整体上看，很难挖掘出任何有生物学价值的信息，所以我们需要借助一些算法来深入挖掘。
生信修炼手册
2020-05-08
1.1K
0
Lnc2Catlas:肿瘤相关的lncRNA数据库
数据库
sql
unity
目前该数据库中共收录了33种肿瘤，27670个lncRNA转录本的信息，通过Browse按钮，可以按照肿瘤类型查看相关信息，以乳腺癌为例，结果如下
生信修炼手册
2019-12-19
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