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采用igraph包分析网络数据
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对于网络的可视化和数据挖掘,有很多图形界面的软件可供选择,比如cytoscape, gephi 等等,这些软件使用方便,操作简单,功能的强大,但是同时也有着一个缺点,就是无法自动处理,只能通过人工点击鼠标来操作,对于大批量数据的分析而言,依靠人工费事费力。
生信修炼手册
2020-05-08
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如何从PPI网络进一步挖掘信息
数据结构
unity
编程算法
从数据库中得到蛋白质的相互作用信息之后,我们可以构建蛋白质间的相互作用网络,但是这个网络是非常复杂的,节点和连线的个数很多,如果从整体上看,很难挖掘出任何有生物学价值的信息,所以我们需要借助一些算法来深入挖掘。
生信修炼手册
2020-05-08
1.2K
0
Lnc2Catlas:肿瘤相关的lncRNA数据库
数据库
sql
unity
目前该数据库中共收录了33种肿瘤,27670个lncRNA转录本的信息,通过Browse按钮,可以按照肿瘤类型查看相关信息,以乳腺癌为例,结果如下
生信修炼手册
2019-12-19
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