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ChAMP分析甲基化数据：标准流程

上次主要演示了ChAMP包需要的样本信息csv文件的制作以及IDAT数据读取过程。

医学和生信笔记 2022-11-152022-11-15 12:44:34

文件存储

DiseaseMeth 2.0：给你一个甲基化分析神器，让你和R“Say Goodbye”!

DNA甲基化，对于做科研的小伙伴们或多或少不陌生吧，而R语言复杂的代码加上报错也常常让小伙伴们怒砸键盘不已！今天，小编给大家分享一个神器，让你轻松搞定甲基化数据...

百味科研芝士 2019-05-232019-05-23 22:43:27

数据库、sql

甲基化芯片的一般分析流程

同样的策略，我们也可以应用到其它领域的知识背景快速学习，比如我们的lncRNA系列，miRNA系列，现在我们一起学习一下甲基化吧。

生信技能树 2020-02-202020-02-20 15:03:45

硬件开发、数据分析、数据库、sql

使用TCGAbiolinks进行甲基化和转录组数据的联合分析

DNA甲基化作为表观遗传的一种重要标记，在基因表达调控中发挥重要作用，已有研究表明，位于启动子区的甲基化会抑制基因表达。结合甲基化数据和基因表达谱数据，可以更好...

生信修炼手册 2019-12-192019-12-19 15:59:40

硬件开发

甲基化分析神器--UALCAN

在做差异表达的分析时，我们已经分享过oncomine+GEPIA双确认，oncomine+TIMER以及oncomine+UALCAN双确认两种方式。关键是双确...

芒果先生聊生信 2020-08-052020-08-05 23:40:49

数据分析、数据库、sql

如何从TCGA数据库下载DNA甲基化数据

前面给大家介绍了新版的TCGA数据库，通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据，miRNAseq数据以及体细胞突变数据

生信交流平台 2022-09-212022-09-21 19:35:06

数据库、sql、typescript

【生信文献200篇】59 利用DNA甲基化和RNA-seq分析获得乳腺癌DNA甲基化调控基因

英文标题 Identification of epigenetic modulators in human breast cancer by integrate...

生信菜鸟团 2021-08-252021-08-25 15:17:27

数据分析

850K甲基化芯片数据的分析

作者是生信技能树组建的表观遗传学学习小组的小组长，前面已经发过一个：学员分享-Chip-seq 实战分析流程本文是看到生信技能树有个450K甲基化芯片数据处...

生信技能树 2018-03-092018-03-09 10:22:14

数据处理、数据分析

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TA 很懒，什么都没有留下╮（╯＿╰）╭

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