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12分NC教你构建缺氧评分和扩展分析

今天跟大家分享的是2020年发表在NATURE COMMUNICATIONS (IF:12.121)杂志上的一篇文章"Divergent mutatio...

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一文读懂DNA甲基化及BS-seq

DNA甲基化是一个生物过程,它会在在DNA分子中引入甲基化基团,但是甲基化并不会改变序列本身,而会改变DNA片段的活性。

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肝移植IRI相关的细胞及分子机制(一)

原文题目为:Ischaemia reperfusion injury in liver transplantation: Cellular and molecu...

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R:如何使用RMarkdown渲染中文pdf报告

Rmarkdown作为一种将R等编程语言和Markdown的简洁语法结合在一起的增强版Markdown语法,其在报告输出、数据分析、沟通交流中的易用性和便利性已...

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sklearn 模型的保存与加载

在我们基于训练集训练了 sklearn 模型之后,常常需要将预测的模型保存到文件中,然后将其还原,以便在新的数据集上测试模型或比较不同模型的性能。其实把模型导出...

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Nature 子刊:IncRNA在肿瘤发生中的深度分析

今天跟大家分享的是2020年3月发表在Communications Biology(IF=4.165)杂志上的一篇文章Cancer LncRNA Census ...

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笔记日记debug,推荐这个插件里的模板

如果你对所谓5分钟笔记模板或者我在日记记录了什么感兴趣,可以收听最新一期熊言熊语的番外更新。

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一文读懂染色质可及性与ATAC-seq

人的DNA链全部展开大约有2m,需要折叠为染色质结构才可以存储到放到细胞核中。染色质的基本结构单位是核小体(由组蛋白组成),核小体再折叠最终形成高度压缩的染色质...

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用 eggnog-mapper 进行功能注释

eggnog-mapper 是一种用于对未知序列进行快速功能注释的工具。它使用 eggNOG 数据库中预先计算好的直系同源基因组和系统发育树,根据其进化关系推断...

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Nat Biotechnol: Butler,一种轻松处理725 TB数据基因组的高效云分析方案

今天跟大家分享的是2020年2月发表在NATURE BIOTECHNOLOGY(IF:36.558)杂志上的一篇文章"Butler enables rapid ...

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Python 3.9 值得关注的更新点

2020年8月19日,Python 最新释放bate版本 3.9.0rc1,呼之欲出的新版,提前来看看吧~

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Nature immunoloy | 新冠肺炎患者的单细胞免疫图谱

原文题目为:Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19

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在 Pycharm 中安装及使用 Jupyter (图文详解)

Pycharm 更新了对 Jupyter 的功能支持,结合 IntelliJ 的自动补全代码,自动格式化代码,执行调试,版本控制,以及大量的插件支持。

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python魔法方法是什么

“在Python中,魔法方法是指Python内部已经包含的,被双下划线所包围的方法,这些方法在进行特定的操作时会自动被调用,它们是Python面向对象下智慧的结...

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使用Python实现基本初等函数可视化

Matplotlib 是第一个Python数据可视化库,是python社区中使用最广泛的绘图库。其设计风格非常类似于1980年代开发的专有编程语言MATLAB,...

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有效读文献的十大简单规则

下面会分别介绍这十个规则,规则1-5是总体建议,规则6-8与阅读哲学理论相关,规则9-10指导你阅读后该做什么问什么?

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使用 Zotero 在 Markdown 中优雅处理参考文献

兵马未动粮草先行,写大大小小的各种论文需要做很多思想建设,有一个顺手的写作工具和一个方便的文献管理工具可以给人一些动力和勇气。

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MicrobiomeAnalyst | 零代码分析宏基因组数据

MicrobiomeAnalyst 是一个方便易用的宏基因组数据分析网站,它可以使没有生物信息学研究背景的研究人员和临床医生通过可视化界面自由探索微生物组数据,...

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Nat Comm:如何推断结构变异癌细胞分数

今天跟大家分享的是2020年2月发表在Nature Communications(IF=11.878)杂志上的一篇文章Inferring structural ...

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PubMed使用者指南3.0

剪贴板提供了一个可以保存来源于不同研究引文的空间,最多可达五百条。存储于剪贴板的引文在八小时的静止状态后会过期。

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