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由于老板给定的研究方向是做单细胞组学的,跟以往的组学都是不太一样的,导致学的相当吃力,同时网上的一部分的代码是分段的,有的时候学习不到相关的分析的思路,因此看到...
注 | 以下操作指南中涉及的消化酶以及实验方法仅供参考,实际应用过程中请根据具体情况进行细节上的调整。
人类疾病通常呈现异常的细胞类型或细胞状态。单细胞技术的发展可以在单细胞分析率下全面绘制复杂组织的分子特征。到目前为止,大多数肺细胞图谱研究都依赖于活检样本或支气...
1.心脏组织拥有20类免疫细胞簇,这些细胞簇与疾病发展有密切相关关系。其中丰度前三的细胞群是巨噬细胞、B细胞、NK细胞。免疫细胞簇的丰度随着疾病发展发生了变化,...
糖尿病足溃疡 (DFU) 是糖尿病的一种严重并发症,其发病机制还不清楚。本文使用单细胞转录组对患者足部、前臂和外周血单核细胞的 174,962 个单细胞进行分析...
结果:文章主要探究三个主要的亚群(成纤维,内皮,角质)和免疫相关基因之间的联系,侧面证明成纤维细胞、内皮细胞中可能促进过敏性皮肤炎症的新途径。OVA致敏导致T细...
(1)对3个MCAO(24h)与3个对照小鼠样本的左脑半球(left cerebral hemispheres)进行单细胞测序;
首先利用大鼠全层伤口模型发现取向组诱导创缘再上皮化效果最好、皮肤附属器官再生更多,皮下模型提示取向组的纤维沉积更少,伤后7天皮肤组织bulk 测序(n=3)提示...
注意到其他两篇文献中骨骼肌、心肌的mesenchymal progenitors(MP),Hic1标记,且受伤后被激活。自己单细胞数据也鉴定出HF 间质部分的H...
成年脊椎动物中许多重要的细胞类型都具有间充质来源,包括成纤维细胞和血管壁细胞。它们的生物学重要性无可争议,但器官内和器官之间的间充质细胞异质性水平尚未得到详细分...
在人类月经周期中子宫内膜经历了重塑、脱落和再生,所有的过程都是由潜在细胞层次中大量基因表达的改变驱动的。尽管在人类生育和再生中很重要,但对这一特异的组织内稳态类...
In vertebrates, multipotent progenitors located in the pharyngeal mesoderm form ...
不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,很幸运聚集了五个小伙伴携手共进,我们承诺不间断更新5个月,把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家,包括5个栏目:
这是 Tang Ming 大神分享的单细胞分析的seurat流程。今天我们来理一下大致的分析思路,当然里面好多细节的部分还需要自己下功夫慢慢研究。
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TA 很懒,什么都没有留下╮(╯_╰)╭